WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 || 3 |

(США), определение глюкозы в плазме крови с по- лимеразной цепной реакции осуществлялось в два мощью глюкометра, биохимический анализ крови этапа с добавлением праймеров, специфичных к (общий холестерин, липопротеиды высокой и низкой исследуемым генам. Флуоресцентное мечение проплотности, триглицериды, креатинин), общий анализ дукта полимеразной цепной реакции (ПЦР) провомочи (определение протеинурии), офтальмоскопия дили на втором этапе реакции с помощью красителя (для выявления гипертонической ретинопатии), су- пентаметинового ряда. При этом праймер, содержаточный мониторинг артериального давления (АД), щий флуоресцентную метку, добавляли в ПЦР-смесь офисное измерение АД по методу Короткова. в более высокой концентрации, чем немеченый В качестве биологического материала для гене- праймер, таким образом, чтобы преимуществентических исследований использовалась перифери- но нарабатывалась одна меченая цепь. В процессе ческая кровь. Весь материал был собран с соблю- дальнейшей гибридизации на биочипе происходило дением процедуры информированного согласия специфическое взаимодействие молекул-зондов и пациентов. Забор крови у каждого из пациентов вы- молекулы-мишени по принципу комплементарности.

полнялся однократно. ДНК выделяли из лейкоцитов Гибридизационную смесь полностью денатурировапериферической крови с помощью набора wizard ли в течение 5 минут при 95°С, охлаждали во льду, genomic DNa Purification Kit (Promega, США) в соот- наносили на биочип и инкубировали в течение 10 – ветствии с инструкцией производителя. часов при 37°С. После завершения инкубации и удаБиочипы — массивы ячеек, содержащих различ- ления гибридизационной смеси поверхность бионые молекулярные зонды. Биочипы изготовлены ме- чипа высушивалась сжатым воздухом, проводилась тодом фотоиндуцируемой совместной полимериза- регистрация флуоресцентных сигналов с помощью ции олигонуклеотидов и компонентов акриламидного портативного анализатора, снабженного программгеля. Гелевые ячейки микрочипа полусферической ным обеспечением Imagewer (Институт молекулярформы химически пришиты к твердой поверхности, ной биологии им. В. А. Энгельгардта РАН, Россия).

в каждой ячейке иммобилизированы молекулы зон- Картина гибридизации представляет собой распреда одного типа. Зонды нанесены на поверхность деление сигналов флуоресценции, наиболее ярких в микрочипа в определенной последовательности, точках специфического связывания зонда и мишени.

размер ячеек составляет 150 мкм. Проведение по- Метод использования ДНК-чипов высокоинформати Saratov Journal of Medical Scientific Research. 2012. Vol. 8, № 3.

754 внУтренние БолеЗни вен, позволяет анализировать до 50 полиморфных вариантов генов с точностью более 99 %. Возможность изучения полиморфизмов генов на чипах в ходе исследования предоставлена ООО «Геночип» г. Саратов.

В процессе гибридизации происходит специфическое взаимодействие молекул-зондов и молекулымишени по принципу комплементарности. Для того чтобы выявить возникающие в ходе гибридизации стабильные структуры и определить, с каким зондом произошло взаимодействие, молекулы-мишени предварительно метят флуоресцентным красителем.

Таким образом, картина гибридизации представляет собой картину распределения флуоресцентных сигналов, наиболее ярких в точках специфического связывания зонда и мишени.

С помощью метода ДНК-чипов в нашей работе оценивался полиморфизм генов, ответственных за энзиматическую активность ферментов 5,10-метилентетрагидрофолатредуктазы и N-ацетилтрансферазы.

Изучалась распространенность следующих гомозиготных мутаций гена NaT2, приводящих к «медленному» ацетилированию: NaT2*5a, 341Tc; NaT2*5B 481cT; NaT2*6a, 282cT; NaT2*6B 590ga;

NaT2*7B, 857ga.

К увеличению концентрации гомоцистеина в Рис. 2. Полиморфизмы 677-го нуклеотида гена MTHFR на плазме крови ведет мутация гена 5,10-метилентеродительских хромосомах: С677С – «дикий» тип, С677Т – трагидрофолатредуктазы (MTHFR). Это приводит к гетерозигота, Т677Т – гомозигота по рецессивному признаку структурным изменениям фермента метилентетрагидрофолатредуктазы: аланин замещается валином, ных за метаболические превращения гомоцистеина изменяются каталитические свойства фермента. При и ацетил-коэнзима А (MTHFR, NaT2*5a, NaT2*5B, гетерозиготной мутации этого гена происходит замеNaT2*6А, NaT2*6B, NaT2*7B). Приведено распрена цитозина на тимин в 677-м нуклеотиде (мутация деление генетического полиморфизма по стадиям заС677Т). Генотип ТТ является мутантным, СС — немуболевания в популяции больных АГ (табл. 1, 2).

тантным («дикий» тип), СТ — гетерозиготным (рис. 2).

В исследовании оценивались мутации гена NaTСтатистическая обработка данных выполнялась (341Tc, 481cT, 282cT, 590ga, 857ga), с использованием программного пакета Statistica 6.1.

приводящие к «медленному» ацетилированию (см.

Сравнение частот встречаемости признаков выполнятабл. 1). Среди больных АГ 1-й стадии достоверно ли на основе критерия Хи-квадрат. Зависимости покачаще, относительно пациентов с 2-й и 3-й стадиями зателей оценивали на основе корреляции R Спирмена.

заболевания, встречались «медленные ацетиляторы» Результаты. С помощью «фармакогенетического» биочипа определен полиморфизм генов, ответствен- (гомозиготы по мутантному варианту гена NaT2), обТаблица Распределение гомозиготных мутаций наиболее распространенных аллелей NAT2, приводящих к «медленному» ацетилированию, у больных АГ 1-3-й стадий NaT2*5a NaT2*5B NaT2*6B NaT2*7B Стадии АГ NaT2*6a 282cT 341Tc 481cT 590ga 857ga 1-я (n=54) 14 (25,9%) 17 (31,5%) 23 (42,6%) 26 (48,1%) 11 (20,4%) 2-я (n=50) 8 (16,0%) 10 (20,0%) 11 (22,0%)* 8 (16,0%)* 2 (4,0%)* 3-я (n=56) 6 (10,7%)* 10 (17,9%) 3 (5,4%)*+ 7 (12,5%)* 2 (3,6%)* П р и м е ч а н и е : данные представлены в виде n (%). Частота встречаемости генотипов (%) рассчитана от общего числа наблюдений в каждой из групп пациентов; * – статистически значимые (р<0,05) различия с группой больных АГ 1-й стадии; + – статистически значимые (р<0,05) различия с группой больных АГ 2-й стадии.

Таблица Распределение полиморфных вариантов 677-го нуклеотида гена MTHFR у больных АГ 1-3-й стадий Вариант генотипа Общая группа (n=160) АГ 1-я стадии (n=54) АГ 2-я стадии (n=50) АГ 3-я стадии (n=56) СС, n (%) 62 (38,8%) 34 (63,0%) 18 (36,0%)* 10 (17,9%)*+ СТ, n (%) 51 (31,9%) 14 (25,9%) 16 (32,0%) 21 (37,5%) ТТ, n (%) 57 (35,6%) 6 (11,1%) 16 (32,0%)* 25 (44,6%)* П р и м е ч а н и е : Частота встречаемости генотипов в процентах (%) рассчитана от общего числа наблюдений в каждой из групп пациентов;

СС – гомозиготное носительство аллеля С полиморфизма 677-го нуклеотида гена MTHFR; СТ – гетерозиготное носительство аллеля Т; ТТ – гомозиготное носительство аллеля Т; * – статистически значимые (р<0,05) различия с группой больных АГ 1-й стадии; + – статистически значимые (р<0,05) различия с группой больных АГ 2-й стадии.

Саратовский научно-медицинский журнал. 2012. Т. 8, № 3.

INteRNAL DISeASeS условленные практически всеми изучаемыми типами Кроме того, нами показана высокая распрострамутаций гена, кроме [NaT2*5B, 481cT] (см. табл. 2): ненность гомозиготного носительства мутантного ал— NaT2*5a, 341Tc (р=0,22 и р=0,041 соответ- леля Т гена MTHFR (генотип ТТ), детерминирующего ственно; обращаем внимание, что различия по дан- сниженную энзиматическую активность 5,10-метиной мутации с больными АГ 2-й стадии статистиче- лентетрагидрофолатредуктазы у больных АГ, что ски незначимы); свидетельствует о нарушении обмена метионина у — NaT2*6a, 282cT (р=0,027 и р<0,0001 соот- данной категории пациентов. В работах последних ветственно); лет рядом авторов было показано, что у пациентов с — NaT2*6B, 590ga (р=0,0007 и р=0,0001 соот- мутацией гена MTHFR (особенно гомозигот с генотиветственно); пом ТТ) уровень гомоцистеина в крови, как правило, — NaT2*7B, 857ga (р=0,013 и р=0,008 соответ- на 25 % выше, чем у лиц с генотипом СС. Выявлено, ственно). что у людей с такой мутацией повышен риск развиСравнивая группы пациентов с АГ 2-й и 3-й стадий, тия сердечно-сосудистых заболеваний, сахарного удалось выявить статистически значимые различия диабета, атеросклероза, поздних осложнений берепо частоте встречаемости [NaT2*6a, 282cT] мута- менности и др. [10].

ции гена NaT2 (р=0,013), обусловливающей «мед- Мы полагаем, что наличие того или иного поленное» ацетилирование (см. табл. 1). лиморфного варианта гена MTHFR по 677-му Анализ полиморфизма в 677 нуклеотиде гена нуклеотиду оказывает непосредственное влияние MTHFR показал, что в 57 образцах (35,6 % образцов на тяжесть течения АГ. В частности, отсутствие ДНК в общей группе) определен мутантный генотип мутаций на уровне данного нуклеотида (генотип ТТ. Гетерозиготы и гомозиготы по немутантному ал- СС) у большинства пациентов способствует более лелю С распределились следующим образом: гомо- «мягкому» течению заболевания с отсутствием зиготное носительство (генотип СС) присутствовало поражений органов-мишеней и ассоциированных у 62 пациентов (38,8 % от общей группы); гетерози- клинических состояний, появление которых в той или готное носительство (генотип СТ) — у 51 пациента иной мере ассоциируется с выявлением мутантного (31,9 % от общей группы) (см. табл. 2). Выявлено, что аллеля Т данного гена (генотипы СТ и ТТ).

группы больных АГ 2-й и 3-й стадии сопоставимы по Необходимо отметить, что методика изучения гечастоте встречаемости у них генотипа ТТ (р=0,19), тог- нетического полиморфизма на основе ДНК-биочипов да как при 1-й стадии АГ частота встречаемости дан- предполагает в перспективе внедрение на матрицу биочипа новых зондов для определения малоизученного генотипа статистически значимо ниже (р=0,01 и p=0,0002 соотвественно) (см. табл. 2). Частота встре- ных генетических маркеров, участвующих в основных метаболических процессах, что облегчит понимание чаемости генотипа СТ была сопоставима (р>0,05) многих патогенетических процессов при АГ.

во всех исследуемых группах больных АГ. Генотип Заключение. Описанные в работе молекулярноСС достоверно чаще наблюдался у больных АГ 1-й генетические маркеры метаболических процессов стадии (р=0,007 и p<0,0001 при сравнении с АГ 2-й и вовлечены в регуляцию артериального давления.

3-й степени соотвественно). Отметим, что различия в частоте встречаемости генотипа СС между больны- В популяции больных АГ имеется закономерность распределения полиморфизмов генов, ответственми АГ 2-й и 3-й стадий также статистически значимы (р=0,037), при этом наиболее редко встречается дан- ных за активность ферментов 5,10-метилентетрагидрофолатредуктазы, участвующей в метаболизме ный генотип при 3-й стадии АГ (см. табл. 2).

гомоцистеина, и N-ацетилтрансферазы, обеспечиУстановлена статистически значимая средней вающей процесс превращения ацетил-коэнзима А силы зависимость стадии АГ от наличия мутантных в ацетоацетил-коэнзим А. Мутации этих генов при аллелей Т (гетеро- и гомозиготный варианты) в 677-м определенных условиях могут влиять на течение АГ.

нуклеотиде гена MTHFR (r=0,40, р<0,001).

Дальнейшее изучение генетических маркеров белкоОбсуждение. В нашем исследовании показано, вого, углеводного и жирового обменов существенно что среди больных АГ 1-й стадии достоверно чаще встречаются индивиды с аллелями гена NaT2, об- облегчит понимание патогенеза заболевания и подусловливающими «медленный вариант ацетилиро- бор фармакологических препаратов для лечения артериальной гипертензии.

вания». Наиболее часто встречаются гомозиготные Конфликт интересов. Работа выполнена в рамварианты генотипа 282СТ аллельного варианта ках диссертационного исследования О. В. Шевченко NaT2*6a и 590 ga аллельного варианта NaT2*6B.

Исходя из полученных результатов, можно предпо- и не имеет коммерческой заинтересованности физических или юридических лиц.

ложить, что «медленные» аллельные варианты гена NaT2 способствуют снижению уровня фермента Библиографический список N-ацетилтрансферазы, замедляя тем самым реак1. Oparil S., Zaman a., calhoun D. a. Pathogenesis of цию превращения ацетил-коэнзима А в ацетоацетилhypertension // ann. Intern. Med. 2003. Т. 139. С. 761 – 176.

коэнзим А и нарушая всю многоэтапную цепь синтеза 2. cattaneo M. Hyperhomocysteinemia, atherosclerosis and холестерола.

Thrombosis // Thromb. Haemost. 1999. Т. 81. С. 165 – 176.

В результате мутации в 677-м нуклеотиде (мута3. Loscalzo J. The oxidant stress of hyperhomocysteinemia // ция С677Т) фермент MTHFR становится термолаJ. clin. Invest. 1996. № 98. P. 5 – 6.

бильным, снижается его удельная активность, нару- 4. Хубутия М. Ш., Шевченко О. П. Гомоцистеин при коронарной болезни сердца и сердечного трансплантата. М.: Решается реметилирование гомоцистеина в метионин.

афарм, 2004. 272 с.

По нашим данным, не выявлено статистически значи5. Hein D. w., Doll M. a, Fretland a. J. Molecular genetics and мых различий по частоте встречаемости типа С677Т epidemiology of the NaT1 and NaT2 acetylation polymorphisms.

мутации гена MTHFR у больных АГ разных стадий, // cancer epidemiol. Biomarkers Prev. 2000. Т. 1, № 9. Р. 29 – 42.

однако можно отметить недостоверную тенденцию 6. Vatsis K. P., weber w. w., Bell D. a. Nomenclature for к увеличению частоты встречаемости по мере повыN-acetyltransferases // Pharmacogenetics. 1995. Т. 1, № 5.

шения стадии течения заболевания (см. табл. 2). С. 1 – 17.

Saratov Journal of Medical Scientific Research. 2012. Vol. 8, № 3.

756 внУтренние БолеЗни 7. Сулейманов С. Ш. Особенности функционирования 4. Hubutija M. Sh., Shevchenko O. P. gomocistein pri системы биотрансформации ксенобиотиков в адаптивных koronarnoj bolezni serdca i serdechnogo transplantata. M.:

реакциях и патологии малочисленных народов Крайнего Се- Reafarm, 2004. 272 s.

5. Hein D. w., Doll M. a, Fretland a. J. Molecular genetics and вера: автореф. дис. … д-ра мед. наук. 1997. 47 с.

epidemiology of the NaT1 and NaT2 acetylation polymorphisms.

8. evans D. a. P. N-acetyltransferase // Pharm. Therap. 1989.

// cancer epidemiol. Biomarkers Prev. 2000. T. 1, № 9. R. 29 – 42.

Т. 42. С. 157 – 234.

6. Vatsis K. P., weber w. w., Bell D. a. Nomenclature for 9. Сравнительный анализ результатов фенотипирования N-acetyltransferases // Pharmacogenetics. 1995. T. 1, № 5.

и генотипирования по полиморфизму N-ацетилирования у S. 1 – 17.

человека / И. В. Голденкова-Павлова, С. А. Брускин, Р. М. Аб7. Sulejmanov S. Sh. Osobennosti funkcionirovanija sistemy деев [и др.] // Генетика: журнал Российской академии наук.

biotransformacii ksenobiotikov v adaptivnyh reakcijah i patologii 2006. Т. 42, № 8. С. 1143 – 1150.

malochislennyh narodov Krajnego Severa: avtoref. dis. … d-ra 10. Heux S., Morin F., Lea R. a. The methylentetrahydrofolate med. nauk. 1997. 47 s.

Pages:     | 1 || 3 |



© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»

Материалы этого сайта размещены для ознакомления, все права принадлежат их авторам.
Если Вы не согласны с тем, что Ваш материал размещён на этом сайте, пожалуйста, напишите нам, мы в течении 1-2 рабочих дней удалим его.