WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 || 3 | 4 |

С помощью трёх праймеров для пяти изученных популяций было получено 62 фракции ДНК. Доля полиморфных локусов составила 79 %. При суммарном объёме выборок 98 особей, 9 из 62-х (14,5 %) фракций по RAPD-маркерам встречались у единичных особей. Средняя гетерозиготность в популяциях варьировала от 0,152 (Звенигородка, 2003) до 0,195 (Чемал 2003, Никополь 2003). При объединении данных по всем популяциям гетерозиготность HT=0,186, а HS=0,161. В парах популяций отмечены различия в частотах отдельных фракций ДНК. Значения генетических расстояний DNei варьировали в интервале от 0,0069 (в паре Ижевск 2002, Звенигородка 2003) до 0,0214 (в паре Ижевск 2002, Умань 2003). Значения генетических расстояний GD варьировали от 0,113 (в паре Звенигородка 2003, Никополь 2003) до 0,179 (в парах Чемал 2003 – Никополь 2003 и Чемал 2003 Умань 2003) (Табл. 2). Расчётные значения потока генов, Nm, оцененные непрямым методом через GST, варьировали в парах популяций от 9,2 (в паре Ижевск 2002, Умань 2003) до 25,0 (в паре Ижевск 2002, Звенигородка 2003) мигрантов на поколение. Несмотря на ряд допущений, принимаемых при расчёте уровня миграции между популяциями (допущение о соответствии системы островной модели С. Райта), расчётные значения потока генов, по-видимому, указывают на значительный уровень миграции между изучаемыми популяциями D. melanogaster (Wright, 1931, Whitlock, Mccauley, 1999).

Меры генетического расстояния и оценки потока генов указывают на низкую степень дифференциации изученных популяций. Низкая дифференциация так же характерна и для западноевропейских популяций Drosophila melanogaster (Schltterer et al., 2006). Высокая степень сходства между популяциями объясняется единством их происхождения и (или) интенсивным миграционным процессом между ними. Оценка генетических расстояний указывает на существование определённых различий в частотах и представленности анализируемых аллельных вариантов фрагментов ДНК между евразийскими популяциями D. melanogaster.

Таблица 2. Значения генетического расстояния между популяциями.

Мера генети­ческого расстояния

Выборки

Ижевск, 2002

Звенигородка, 2003

Никополь, 2003

Умань, 2003

DNei (1972)

Чемал, 2003

0,0107

0,0133

0,0098

0,0123

Ижевск, 2002

0,0069

0,0129

0,0214

Звенигородка, 2003

0,0169

0,0183

Никополь, 2003

0,0122

GD

Чемал, 2003

0,078

0,115

0,179

0,179

Ижевск, 2002

0,115

0,135

0,164

Звенигородка, 2003

0,113

0,182

Никополь, 2003

0,143

Динамика изменчивости геномной ДНК в популяции D. melanogaster Умани с 1984 по 2004 годы, выявляемая методом ISSR-PCR

Для всех 6 выборок с помощью трёх праймеров было получено 30 фракций ДНК. Спектр фракций для каждого из праймеров был специфичным как по уровню изменчивости, так и по набору выявляемых фрагментов ДНК. Доля полиморфных локусов составила 80 %. При суммарном объёме выборок 124 особи, 5 из 30 (16,7 %) фракций встречались у единичных особей. Средняя гетерозиготность HS в данном ряде выборок составила 0,103. В большинстве пар выборок отмечены различия по частотам аллелей, обуславливающих проявление отдельных фракций ДНК. Отмечено 12 таких вариабельных фракций. Не отличаются по частотам отдельных доминантных аллелей только две пары выборок 1984/1991 и 1991/2003 гг. Следует отметить, что между выборками 1984 и 2003 годов имеются различия в частотах выявления трёх фракций ДНК. В связи с большим значением ошибки при расчёте частоты доминантного аллеля в выборках 2003 и 2004 годов, расстояния по мере DNei были оценены только для выборок 1984-1991 годов. Значения DNei для этих выборок малы (от 0,004 – в паре выборок 1984 и 1991 годов, до 0,012 – в паре выборок 1988 и 1990 годов) и коррелируют со значением GD (Табл. 3, 4), которое находится в разных парах выборок в интервале от 0 до 0,179 (коэффициент корреляции 0,617±0,394).

Какой-либо направленности

Таблица 3. Значения генетического расстояния (GD) между выборками Drosophila melanogaster Умани разных лет.

Год

1988

1990

1991

2003

2004


1984

0,077

0,111

0,000

0,080

0,040


1988

0,172

0,077

0,148

0,038


1990

0,111

0,179

0,143


1991

0,080

0,040


2003

0,115

в изменении частот выявляемых с помощью ISSR-маркеров фракций ДНК в популяции D. melanogaster г. Умань не выявлено (Рис. 2). Данные, полученные по динамике изменчивости ISSR-маркеров геномной ДНК в изученной популяции D. melanogaster указывают на то, что популяция длительное время остаётся стабильной, при определённых межгодовых вариациях. Хаотичность изменений в частотах фракций ДНК указывает на то, что из основных факторов микроэволюции – мутационного процесса и отбора, дрейфа генов и миграции, по-видимому, доминирующую роль в генетических изменениях популяции Drosophila melanogaster Умани, выявляемых методом ISSR-PCR, играют два последних.

Таблица 4. Значения генетического расстояния DNei между выборками Drosophila melanogaster Умани разных лет.

Год

1988

1990

1991

1984

0,006

0,006

0,004

1988

0,012

0,011

1990

0,005

Значения средней гетерозиготности, выявленные нами в популяциях Drosophila melanogaster методами мультилокусных маркеров, оказались сравнимыми с оценками, полученными для этого вида по изоферментным маркерам, но ниже, чем эти же значения у Aedes aegypti и Chironomus riparius, полученные для RAPD-маркеров (Рис. 2).

Особенности оценки мер генетического расстояния

Проведёна оценка факторов, влияющих на оценку и интерпретацию значений мер генетических расстояний DNei и GD. Выявлено, что обе меры зависят от числа проанализированных образцов и доли новых маркеров, принимаемых в анализ при изменении объёма изучаемого материала. В частности, если минимальное значение генетического расстояния для D. melanogaster при межпопуляционных сравнениях по

Рис 2. Полигоны частот доминантных аллелей ISSR-маркеров в выборках из популяции Drosophila melanogaster г. Умань в период с 1984 по 2004 г. На радиусах указаны условные порядковые номера фракций, закрашенная по радиусу часть полигона соответствует частоте соответствующего доминантного аллеля. Радиусы с номерами 1–9 соответсвуют праймеру (AG)8G, с номерами 10–13 – праймеру (CT)8A 14–30 – праймеру (CA)8G; в пределах области соответствующей одному праймеру радиусы располагаются в порядке убывания размера соответствующих фрагментов ДНК.

Рис. 3. Средняя гетерозиготность в популяциях видов Diptera по изоферментным и мультилокусным маркерам (по: Singh 1989; Apostol et al., 1996; Гундерина, Салина, 2003; Ваулин и др., 2007; Ваулин, Захаров, 2008; Ваулин и др., неопубликованные данные). Есть различия (p<0,05) в гетерозиготности по мультилокусным маркерам (RAPD и ISSR) в парах сравнений: D. melanogaster и C. riparius; D. melanogaster и A. aegipti; An. messeae A и A. aegipti. По изоферментам нет данных об объёмах выборок.

RAPD-маркерам было получено в паре выборок «Ижевск 2002 – Звенигородка 2003» (табл. 1) и составляло 0,0069, то при учёте только тех фракций ДНК, которые были детектированы нами в данной паре выборок, значение DNei возрастало до 0,0085. Если при сравнении популяций по результатам изучения мультилокусных маркеров, значения меры DNei зависят в большей степени от числа проанализированных выборок и образцов, тогда как значения GD – от объёмов сравниваемых выборок.

По мере расхождения популяций или сравниваемых групп следует ожидать увеличение обеих мер генетического расстояния. При использовании ISSR-маркеров, среди ряда выборок разных лет из популяции Drosophila melanogaster Умани эта зависимость была выявлена (коэффициент корреляции между значениями мер DNei и GD 0,617±0,394). Однако при оценке межпопуляционных генетических расстояний DNei и GD методом RAPD-маркеров были получены значения, между которыми отсутствует эта зависимость (коэффициент корреляции между значениями DNei и GD 0,330±0,334), что является следствием низкой дифференцированности между популяциями.

Популяционная изменчивость фрагмента ДНК гена Adh Drosophila melanogaster

Результаты проведённого исследования показали сохранение гетерозиготности по вариантам нуклеотидной последовательности изучаемого фрагмента гена Adh в линиях, длительно культивируемых в лабораторных условиях. В частности, при проведении анализа осенью 2006 г. выявлены гетерозиготы по этому гену в линиях, выделенных из популяций D melanogaster Бийска 1993 г., Никополя 1997 г. и Бишкека 2004 г. При этом, согласно теоретическим расчётам, после 5 лет содержания линий в лаборатории следует ожидать их почти полную гомозиготность (Алтухов, 2003).

Для популяций D melanogaster Украины, Кавказа и Урала показано преобладание F-формы (исключение составляют полиморфные по этому признаку две линии из Никополя 1997 г.); S-форма была выявлена в популяциях Алтая и Бишкека.

Pages:     | 1 || 3 | 4 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»