WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 |   ...   | 4 | 5 || 7 | 8 |   ...   | 12 |

Поли(глицерофосфат--N-ацетилгалактозаминил-глицерофосфат)/связь –3-P-3 –, с пируват-кетальнойгруппой












Поли(глицерофосфат--N-ацетилгалактозаминил-глицерофосфат)/связь –3-P-4 –, с O-сукцинильнымостатком












Незамещенный 3,5-поли(рибитфосфат)ТК1











1,5-Поли(рибитфосфат) с 2,4-пируват-кетальной группой ТК3










1,3-Поли(глицерофосфат) с -N-ацетилглюкозамином

ТК2







1,3-Поли(глицерофосфат) с -глюкозой












1,5-Поли(рибитфосфат) с боковымиглицерофосфатными олигомерами












1 Шашков и др, 1997;2 Стрешинская идр., 1998; 3Стрешинская и др., 1996.

основная (преобладающая) тейхоеваякислота

Рис. 5. 13С ЯМР-спектры ТКклеточных стенок видов и подвидов Nocardiopsis.

2000; Al-Zarban et al., 2002; Kmpfer et al., 2002).Структуры и комбинация ТК в клеточныхстенках актиномицетов рода Nocardiopsis хорошокоррелируют с филогенетическойгруппировкой этих организмов, основаннойна данных анализа генов 16S рРНК и даннымиДНК-ДНК гибридизации. С другой стороны,филогенетически близкие организмы(сходство генов 16S рРНК до 99,9%) различаютсяпо составу анионных полимеров.

Таблица 3.Дифференцирующиехарактеристики видов и подвидов родаNocardiopsis,основанные на сравнении продуктовхимической деградации общей фракции ТК иликлеточных стенока).

Продукты химическойдеградации

N.dassonvillei ssp.dassonvillei

N.synnematofor-mans

N.halotolerans

N.dassonvillei ssp. albirubida1

N. alba(3 штамма)

N. listeri2

N.metallicа

N. prasina

N.lucentensis 2

N.compostа

N. trehalosi

N.tropica3

Группа N. dassonvillei

Группа N. alba

Кислотный гидролиз

Глицерин

Рибит

Глюкоза

Глюкозамин

Галактозамин

Пировиноградная кислота

Янтарная кислота

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

Щелочной гидролиз

Глицерин

GroP, GroP2

Рибит

RboP, RboP2

RboP3

Э3б)

Фосфодиэфир Gro c GlcNAc

сл

+

+

сл

+

+

сл

+

+

сл

+

+

+

сл

+

+

+

+

сл

+

+

+

сл

+

+

+

сл

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

+

а) +,присутствует;,отсутствует;б) Фосфодиэфирсодержит два остатка глицерина, один–N-ацетилгалактозамин и три фосфатныхгруппы: P-(3/4)-GalpNAc-(12)-snGro-3-P-1-snGro-2-P; 1 Шашков и др, 1997;2 Стрешинская идр., 1998; 3Стрешинская и др., 1996.

В первую группу (табл. 2)N. dassonvillei(N. dassonvillei ssp. dassonvillei, N. synnematаformans, N. halotolerans, N. dassonvillei ssp. albirubida) входят организмы, содержащие вклеточной стенке уникальный, обнаруженныйтолько у представителей этого родаполи(полиолфосфатгликозилполиолфосфат).Штаммы вида N. dassonvillei ssp. dassonvillei, имеют единственную ТК сфосфодиэфирной связью между глицерином иаминосахаром по (-3-P-3-). Два вида N.synnematаformans и N.halotolerans, содержат по две ТК:минорную – сфосфодиэфирной связью между глицерином иаминосахаром по (-3-P-4-) и основную – N. synnematаformans, как и у N. dassonvilleissp.dassonvillei, а N.halotolerans – ТК с кетальносвязанным пируватом; и, наконец, подвидN. dassonvillei ssp.albirubida (Шашков идр, 1997), имеет единственную ТК сфосфодиэфирной связью между глицерином иаминосахаром по (-3-P-4-), но несущую сукцинильный остатокпо гидроксилу при С3 аминосахара.

Во вторую группу (табл.2) N. alba (N. alba, N. prasina, N. composta, N. metallica, N. listeri, N.lucentensis) объединяются виды,содержащие в клеточных стенках различныйнабор полимеров: ТК1, ТК2 и ТК3 (табл. 2). При одинаковомнаборе ТК имеются выраженныеколичестванные различия в их содержании(основная или минорная ТК, N.listeri и N.metallicа), а также степенизамещения и длине цепи полимера (N. lucentensis и N. composta). Два другихизученных организма этого рода N. tregalosei и N. tropica (Стрешинская идр., 1996) содержат в клеточной стенке ТК иныхструктур (табл. 2), имеют низкую степеньфилогенетического родства как между собой,так и с N. dassonvillei и с N. alba.

Следует отметить, чтоименно на этой группе организмов впервыепоказана возможность использования 13С ЯМР-спектров какфингерпринтов для идентификации видов и подвидоврода Nocardiopsis(рис. 5).

Кроме того, виды иподвиды рода Nocardiopsis отличаются по набору и комбинациипродуктов кислотного гидролиза как самихполимеров, так и нативных клеточных стенок,которые могут быть легко определены сиспользованием методов хроматографии(табл. 3). Определение некоторыхспецифических продуктов щелочногогидролиза полимера или нативной клеточнойстенки расширяет таксономическиевозможности при использовании этогоподхода. Например, N. alba и N. listeri, которые характеризуются похожимипрофилями продуктов кислотной деградации(табл. 3), можно отличить друг от друга поналичию в щелочных гидролизатах ихклеточных стенок моно- и бисфосфатоврибита у N. alba.

6.2. Структуры и набортейхоевых кислот клеточных стенок каквидоспецифический маркер актиномицетоврода Glycomyces

В данном разделепроанализированы собственные результатыисследования клеточных стенок 5 штаммовтрех видов рода Glycomyces (семейство Glycomycetaceae подпорядокGlycomycineae): G.harbinensis (три штамма) и G. rutgersensis, а такжеG. tenuis,правомочность выделения которыхподтверждена данными ДНК-ДНК гибридизациии анализа последовательностей 16S рРНКгенов (Labeda et al., 1985).

Виды рода Glycomyces хорошоидентифицируются при сравнении набора иструктур ТК клеточных стенок,установленных химическими и ЯМРспектроскопическими методами (табл. 4). ВидG. tenuisхарактеризуется наличием в клеточныхстенках редко встречающейся

Таблица 4.Тейхоевые кислоты клеточныхстенок видов рода Glycomyces.

Тейхоеваякислота

G. tenuis

G.rutgersensis

G.harbinensis

(три штамма)

1,4-Поли(эритритфосфат), замещенныйпо С2(3) эритрита -глюкозамином

1,3-Поли(глицерофосфат), замещенныйпо С2 глицерина -глюкозойТК1

2,3-Поли(глицерофосфат), замещенныйпо С1 глицерина -глюкозойТК2

Pages:     | 1 |   ...   | 4 | 5 || 7 | 8 |   ...   | 12 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»