WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 | 2 ||

Применение метода сравнительного хромосомного пэйнтинга и бэндинга позволило провести сравнительный анализ кариотипов 1 представителя Dipodoidea и 27 видов Muroidea; еще 10 видов мышиных грызунов были включены в анализ из литературных источников. Из изученных видов 18 являются представителями подсемейства Cricetinae, что делает этот таксон наиболее исследованным с помощью современных молекулярно-цитогенетических методов. По результатам работы была составлена детальная картина кариотипической эволюции грызунов. Путем анализа данных локализации пэйнтинг-проб на хромосомах видов из отряда грызунов и из других отрядов млекопитающих, на основании принципов кладистики и парсимонии, были идентифицированы консервативные сегменты хромосом, унаследованные от общего предка. В результате удалось реконструировать вероятный предковый кариотип группы Sciurognathi c 2n=50, для которого характерны следующие ассоциации сегментов хромосом человека: HSA1/10, 3/19, 3/21, 7/16, 8/4/4, 9/11, 12/22, 12/22, 14/15, 16/19. Пока представители подотряда Hysticomorpha не включены в сравнительные цитогенетические исследования, предложенную структуру кариотипа можно считать предковой для всего отряда грызунов.

Перестройки, описанные с помощью проб M. auratus, являются хорошими филогенетическими маркерами на уровне подотрядных отношений. Из суммы имеющихся на сегодняшний день данных Gбэндинга и пэйнтинга хромосом представителей надсемейства Muroidea, в том числе и наши данные, можно утверждать, что предковый кариотип таксона состоял из 27 элементов и половых хромосом. Кладистический анализ хромосомных характеристик, выявленных в геномах Muroidea, позволил установить детальную схему филогенетических связей между исследованными видами грызунов.

Феномен катастрофической эволюции, описанный для грызунов подотряда Myomorpha, гиббоновых и собачьих, нашел многочисленные подтверждения в рамках данной работы, при этом была показана неравномерность скоростей кариотипических преобразований, установленная ранее только для мышей рода Mus. Формирование кариотипов ныне живущих видов Muroidea сопровождалось разрывами предковых хромосом, их слияния в самых различных комбинациях, инверсиями. Среди исследованных в работе видов особый интерес вызывают T. triton, E. lutescens и M. lybicus кариотипы которых, по сравнению с другими видами, характеризуются огромным числом разрывов и слияний предковых хромосом.

В заключение следует отметить, что общее число видов Myomorpha, изученных нами и другими авторами методом сравнительного хромосомного пэйнтинга, составляет около 3% от всех видов подотряда. Принимая во внимание разнообразие кариотипов в этом таксоне, мы можем предвидеть получение интересных результатов по мере включения в сравнительные цитогенетические и геномные исследования других представителей подотряда Myomorpha.

ВЫВОДЫ

  1. По результатам локализации наборов пэйнтинг-проб золотистого хомячка (Mesocricetus auratus), китайского хомячка (Cricetulus griseus) и домовой мыши (Mus musculus) на хромосомах 27 видов Myomorpha построена интегративная карта хромосом всех исследованных видов.
  2. Исследованы кариотипические взаимоотношения между 17 видами из подсемейства хомяковых Cricetinae (Cricetidae, Myomorpha). Построены сравнительные хромосомные карты для 6 родов хомяковых: Allocricetulus, Cricetulus, Cricetus, Mesocricetus, Phodopus и Tscherskia. Показано, что основными перестройками, сопровождавшими дивергенцию хомяковых, были слияния и разделения предковых хромосомных элементов, инверсии, приобретение блоков гетерохроматина.
  3. Исследованы кариотипические взаимоотношения между 6 видами из подсемейства полевковых Arvicolinae (Cricetidae, Myomorpha). Установлено, что основными перестройками, сопровождавшими эволюцию кариотипов полевковых, были Робертсоновские транслокации.
  4. Предложены предковые кариотипы семейств хомяковых (Cricetidae), мышиных (Muridae), надсемейства Muroidea. Идентифицированы маркерные слияния элементов предковых хромосом, приведшие к формированию кариотипа каждого исследованного вида.
  5. Показана неравномерность скоростей кариотипической эволюции для различных ветвей филогенетического древа Muroidea.
  6. Впервые с помощью пэйнтинг проб человека (Homo sapiens) исследован кариотип представителя подотряда Myomorpha – лесной мышовки (Sicista betulina).
  7. По результатам интеграции ранее опубликованных данных и данных настоящей работы определено положение подотряда Myomorpha на филогенетическом древе грызунов, реконструирован предковый кариотип группы Sciurognathi.

Список работ, опубликованных по теме диссертации:

  1. Трифонов В.А., Перельман П.Л., Романенко С.А., Билтуева Л.С., Графодатский А.С. Филогеномика млекопитающих: цитогенетические аспекты. // Биологические мембраны 2005. Т. 22. №3. С. 210-224
  2. Трифонов В.А., Перельман П.Л., Романенко С.А., Графодатский А.С. Эволюционно-цитогенетическое разнообразие млекопитающих. // В.К. Шумный, Ю.И. Шокин, Н.А. Колчанов, А.М. Федотов (ред.): Биоразнообразие и динамика экосистем: информационные технологии и моделирование. Новосибирск: Изд-во СО РАН, 2006. С. 361-368. (Интеграционные пректы СО РАН; вып. 7).
  3. Krast C., Trifonov V., Romanenko S., Clausen U., Mrasek K., Michel S., Avner P., Liehr T. Molecular cytogenetic characterization of mouse cell line WMP2 by spectral karyotyping and multicolor banding applying murine probes. // Int. J. Mol. Med. 2006. V. 17. P. 209-213.
  4. Liehr T., Starke H., Heller A., Kosyakova N., Mrasek K., Gross M., Karst C., Steinhaeuser U., Hunstig F., Fickelscher I., Kuechler A., Trifonov V., Romanenko S.A., Weise A. Multicolor fluorescence in situ hybridization (FISH) applied to FISH-banding. // Cytogenet Genome Res. 2006. V. 114(3-4). P. 240-244.
  5. Romanenko S.A., Perelman P.L., Serdukova N.A., Trifonov V.A., Biltueva L.S., Wang J., Li T., Nie W., O’Brien P.C.M., Volobouev V.T., Stanyon R., Ferguson-Smith M.A., Yang F., Graphodatsky A.S. Reciprocal chromosome painting between three laboratory rodent species. // Mamm Genome. 2006. V. 17. P. 1183-1192.
  6. Romanenko S.A., Volobouev V.T., Perelman P.L., Lebedev V.S., Serdukova N.A., Trifonov V.A., Biltueva L.S., Nie W., O’Brien P.C.M., Bulatova N.Sh., Ferguson-Smith M.A., Yang F., Graphodatsky A.S. Karyotype evolution and phylogenetic relationships of hamsters (Cricetidae, Muroidea, Rodentia) inferred from chromosomal painting and banding comparison. // Chromosome Res. 2007. V. 15. P. 283-297.
  7. Sitnikova N.A., Romanenko S.A., O’Brien P.C.M., Perelman P.L., Fu B., Rubtsova N.V., Serdukova N.A., Golenishchev F.N., Trifonov V.A., Ferguson-Smith M.A., Yang F., Graphodatsky A.S. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). I. The genome homology of tundra vole, field vole, mouse and golden hamster revealed by comparative chromosome painting. // Chromosome Res. 2007. V. 15. P. 447-456.
  8. Romanenko S.A., Sitnikova N.A., Serdukova N.A., Perelman P.L., Rubtsova N.V., Bakloushinskaya I.Yu., Lyapunova E.A., Just W., Ferguson-Smith M.A., Yang F, Graphodatsky A.S. Chromosomal evolution of Arvicolinae (Cricetidae, Rodentia). II. The genome homology of two mole voles (genus Ellobius), the field vole and golden hamster revealed by comparative chromosome painting. // Chromosome Res. 2007. V. 15(7). P. 891-897
  9. Graphodatsky A.S., Yang F., Dobigny G., Romanenko S.A., Biltueva L.S., Perelman P.L., Violetta R. Beklemisheva, Alkalaeva E.Z., Serdukova N.A., Ferguson-Smith M.A., Murphy W.J., Robinson T.J. Tracking genome organization in rodents by Zoo-FISH. // Chromosome Res. Doi: 10.1007/s10577-007-1191-5.
Pages:     | 1 | 2 ||






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»