WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 || 3 | 4 |

Частоту аллелей микросателлитных локусов pi рассчитывали разработанным нами методом кумулятивного «минус-аллеля». Для проверки эффективности микросателлитного анализа для определения популяционной принадлежности особи проводили “assignment test” (Hansen и др., 2001). FST -статистику Райта (Хедрик, 2003), генетическое расстояние D по Нею (Nei, 1972) вычисляли с помощью программы Arlequin 3.0. (Excoffier и др., 2005). Достоверность различий средних значений оценивали с помощью F-критерия Фишера, t-критерия и 2 (Lewontin, 1972; Хедрик, 2003).

Определение митотипов: «baerii-like» (BL) и «русский» (GUE). BL и GUE митотипы определяли с помощью метода видовой идентификации осетровых рыб, предложенного в работе Мюге и др. (2008).

Результаты исследований

Морфологический полиморфизм популяций русского осетра. Результаты морфометрического анализа азовской популяции в сравнении с каспийской и черноморской приведены в табл. 1.

Таблица 1. Сравнительная характеристика популяций A. gueldenstadtii по морфометрическим показателям

Показатель

Популяции

Каспийская

Азовская

Черноморская

Число лучей в спинном плавнике (D)

среднее значение

41,0

35,7

36,3*

пределы

33–51

27–41

3043

Число лучей в анальном плавнике (А)

среднее значение

25,8

21,9

23,9

пределы

21–33

18–25

2028

Число жаберных тычинок (GR)

среднее значение

23,5

21,5

21,8

пределы

19–29

16–26

1727

Кол-во спинных жучек (DS)

среднее значение

12,1

11,9

12,0

пределы

9–18

8–15

9–15

Кол-во боковых жучек (LS)

среднее значение

39,0

30,5

34,2

пределы

30–50

25–36

27–38

Кол-во брюшных жучек (VS)

среднее значение

9,8

9,6

9,6

пределы

7–12

8–11

7–12

Отношение длины головы к абсолютной длине тела (С/AL), %

18,1

16,4

17,5

Примечание: жирным шрифтом выделены показатели, имеющие промежуточные значения при сравнении трех популяций. Значения показателей каспийской и черноморской популяции приводятся по (Берг, 1948; Подушка, 2003).

Самая большая из трех по численности каспийская популяция обладает большим размахом изменчивости по всем изученным признакам. По большинству морфометрических показателей черноморская популяция занимает промежуточное положение по отношению к каспийской и азовской выборкам (табл. 1). Сравнительный анализ, проведенный на основании данных многолетнего мониторинга размерно-возрастного состава азовской популяции и средних показателей размеров разных возрастных групп каспийской и черноморской популяций, выявил, что азовская популяция характеризуется достоверно более интенсивной скоростью роста (F – 0,93 и 1,10, соответственно, р < 0,05).

Сравнительная межпопуляционная оценка средних значений данных морфометрии, проведенная с помощью F-критерия Фишера, выявила существенное различие только между азовской и каспийской популяциями по единственному морфометрическому показателю – количеству лучей в спинном плавнике (D). Таким образом, полученные результаты показывают, что на практике использование классической морфометрии для идентификации популяционной принадлежности особей неэффективно.

Межпопуляционные различия русского осетра по RAPD-маркерам. Пример RAPD-профилей, полученных для двух нерестовых популяций (каспийской и азовской) русского осетра, приведен на рис. 1.

Рис. 1. Электрофореграмма RAPD-фрагментов русского осетра по праймеру 0РА07. 1–8 – особи азовской популяции, 9–16 – особи каспийской популяции, L - маркер молекулярной массы ДНК /PstI (Fermentas).

Размеры проанализированных RAPD-фрагментов варьировали от 250 до 1000 пн. Общее количество RAPD-фрагментов по пяти использованным праймерам составило 295, из которых 22 являются мономорфными и, при сравнении с RAPD-профилями севрюги и стерляди, видоспецифичными. Среднее количество фрагментов на особь варьировало от 23,2 (ОРА-05) до 30,5 (ОРА-07). Анализ генетической изменчивости выборок русского осетра из азовской популяции, относящихся к поколениям 1978–1983 гг. и 1993–2000 гг., показал недостоверность различий (средние значения гетерозиготности – Hji 0,355+0,135 и 0,316+0,137, соответственно), что свидетельствует об отсутствии в популяции временного тренда.

Сравниваемые выборки каспийской и азовской популяций в целом имеют высокий уровень полиморфизма (табл. 2). Кластерный анализ (UPGMA), проведенный на основании RAPD-спектров, не выявил межпопуляционных различий. На фоне высоких значений внутрипопуляционного полиморфизма (Hji, Р) уровень межпопуляционной дифференциации оказался также недостоверным (FST= 0,011).

Таблица 2. Показатели изменчивости анализируемых групп русского осетра по RAPD-локусам, полученным с помощью пяти праймеров

Популяции

Среднее значение

t-критерий (Р<0.001)

Уровень полиморфизма

Р,%

Среднее значение гетерозигот-ности Hji

Диспер-сия

Var (Hji)

Азовская

0,813

5,809

92,3

0,379

0,060

Каспийская

0,799

93,6

0,396

0,059

Результаты RAPD-анализа использовали для расчета эффективной численности популяций. Оказалось, что для сохранения с 99%-ой вероятностью наиболее редкого RAPD-аллеля (= 0,016) количество производителей, отбираемых для искусственного воспроизводства русского осетра, должно быть не менее 205.

Анализ наследования STR-маркеров русского осетра. Нами получены результаты анализа распределения генотипов в трех экспериментальных скрещиваниях русского осетра. Согласно полученным данным во всех вариантах скрещивания распределение комбинаций аллелей и их частоты у потомства соответствуют тетрасомному типу наследования (достоверность различий оценена с помощью критерия 2).Пример наследования аллелей в экспериментальном скрещивании представлен на рис. 2.

Неполное совпадение опытного и ожидаемого распределения в отдельных случаях наиболее вероятно вызвано ограниченностью размеров выборки потомства. Учитывая менделеевские закономерности, распределение аллельных частот в F1 было использовано для уточнения генотипа гетерозиготных тетраплоидных родителей.

BCDD x ABDE

Рис. 2. Тетрасомный характер наследования в микросателлитном локусе Afug41. Генетический анализ экспериментального скрещивания BCDD x ABDE (в центре) и генотипы полученного потомства (указаны для каждого F1). Каждый потомок наследует два любых аллеля одного родителя, и два другого в случайной комбинации.

Межпопуляционные различия русского осетра по STR-локусам. Данные микросателлитного анализа трех популяций русского осетра по четырем локусам представлены в табл. 3 и на рис. 3.

Анализ STR-спектров выявил в исследованной выборке в среднем более семи аллелей на локус. Все локусы оказались полиморфными. В сумме у проанализированных особей (n=540) в четырех локусах выявлено 74 аллеля. Число аллелей на локус в среднем варьировало от 11,5 (AoxD165) до 17,5 (Afug51). Каждая из исследованных популяций имела набор аллелей, достоверно различающихся по частотам (р<0.01). Исключение составил локус AoxD165, по которому не выявлено различий между каспийской и азовской популяциями.

Рис. 3. Распределение частот аллелей микросателлитных локусов в популяциях русского осетра. По осям абцисс – размеры аллелей, пн; по осям ординат – аллельные частоты, выраженные в долях с обозначением 95%-ных доверительных интервалов.

Таблица 3. Значения показателей межпопуляционной изменчивости русского осетра по микросателлитным локусам

Локус

Число аллелей

Гетерозиготность наблюдаемая, H0

Гетерозиготность ожидаемая, НЕ

Коэффициент внутри выборочный FIS

Азовская популяция

An 20

11

0,940

0,969

0,033

Afug 41

15

0,986

0,998

0,010

Afug 51

13

0,730

0,999

0,267

AoxD 165

10

0,911

0,957

0,035

Среднее значение

0,892

0,096

Каспийская популяция

An 20

13

0,971

0,971

-0,000

Afug 41

23

0,995

0,999

0,005

Afug 51

18

0,837

0,998

0,155

AoxD 165

16

0,962

0,992

0,027

Среднее значение

Pages:     | 1 || 3 | 4 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»