WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 || 3 | 4 |   ...   | 12 |

Удмурты

Удмурты

Респ. Удмуртия,Мало-Пургинский район, с. Малая Пурга

20.

Мордва-мокша

Мордва-мокша

Респ. Мордовия,Старошайгинский р-н

21.

Мордва-эрзя

Мордва

Респ. Мордовия,Ромодановский р-н

22.

Марилуговые

Мари

Респ. Мари Эл, с.Каркатаво

23.

Алтайская

Монгольская

Якуты

Якуты

Респ. Саха (Якутия),Якутский р-н

24.

Тюркская

Башкиры

Илишевский

Респ. Башкирия,Илишевский р-н

25.

Стерлибашевский

Респ. Башкирия,Стерлибашевский р-н

26.

Архангельский

Респ. Башкирия,Архангельский р-н

27.

Белорецкий

Респ. Башкирия,Белорецкий р-н

28.

Абзелиловский

Респ. Башкирия,Абзелиловский р-н

29.

Калмыки

Калмыки

Респ. Калмыкия, г.Элиста

30.

Северо-Кавказская

Адыго-Абхазская

Абхазы

Абхазы

Респ. Грузия,Абхазия, Сухумский р-н

31.

Черкесы

Черкесы

Респ.Карачаево-Черкесия, Малокарачаевскийр-н

32.

Адыгейцы

Адыгейцы-Шапсуги

Респ. Адыгея, с.Лазоревское

33.

АдыгейцыЧерноморского поб.

Респ. Адыгея,Черноморское побережье

34.

Адыгейцыгорных районов

Респ. Адыгея,горные р-ны

и монголоидного компонента.Лингвистическая и этническаяклассификация популяций представлена втаблице 1.

Материалы и методыисследования

В работе использованыпрепараты ДНК, выделенные из образцовкрови, полученных в ходе экспедиций,проводимых Отделом молекулярных основгенетики человека Института молекулярнойгенетики РАН, совместной экспедиции сМедико-генетическим научным центром РАМН,предоставленных Медико-генетическимнаучным центром РАМН, Институтомантропологии, этнографии и фольклора НАНБелоруссии, Институтом ревматологии РАМН.Часть выборок из популяций ВосточнойЕвропы в виде препаратов ДНК предоставленыИнститутом биохимии и генетики Уфимскогонаучного центра РАН, а также Институтоммолекулярной биологии и генетики НАНУкраины.

В результатегенетико-демографического анкетирования,проводимого с целью выявления коренногонаселения, отбирались индивидуумы, которыеявляются потомками уроженцев данногорайона в трех последних поколениях. Отборкрови производился после письменногодобровольного информированного согласияисследуемых лиц, удостоверенного их личнойподписью. Препараты ДНК для исследованийбыли выделены из венозной кровинеродственных доноров. Забор кровиосуществлялся только у взрослогонаселения, медицинскими работникамиместных учреждений. Выделение препаратовДНК из образцов крови проводилосьстандартным фенол-хлороформным методом вОтделе молекулярных основ генетикичеловека Института молекулярной генетикиРАН.

Определениеиндивидуальных генотипов проводили путемПЦР-амплификации минисателлитных локусов3’APOB и D1S80 впрепаратах ДНК, совместногоэлектрофоретического разделения в ПААГпродуктов ПЦР и маркерных наборов. Окраскагелей проводилась при помощи серебра.Синтез маркерных наборов, составленных изаллельных вариантов, имеющих известноеколичество повторов, проводили по схемеСаянтила и др. [Sajantila et al., 1992]. Дляминисателлитного локуса D1S80 аллельныеварианты обозначены в соответствии состандартной номенклатурой [Kasai et al., 1992].Аллельные варианты локуса 3’APOB обозначали всоответствии с номенклатурой Людвига [Ludwiget al., 1989].

Полученныеэкспериментальные данные по частотамгенотипов проверяли на соответствиеравновесному распределениюХарди-Вайнберга при помощи компьютерныхпрограмм «GDA» и «РОРGENE 1.32». Изменчивостьчастоты гена в популяциях [Вейр Б., 1990]рассчитывали при помощи компьютернойпрограммы «GDA». Гетерозиготностьрассчитывали при помощикомпьютерной программы «POPGENE 1.32».Достоверность различий оценивали покритерию максимального правдоподобия припомощи компьютерной программы "RxC". Для проведения многомерногоанализа методом метрическогомногомерного шкалирования, а также методомсредневзвешенной связи кластерногоанализа использовалиматрицы стандартных генетическихрасстояний Нея [Nei, 1978],расчеты проводили при помощи программы«Statistika 6.0».

Полиморфизм минисателлитноголокуса 3’-концевой области гена АроВ в популяцияхВосточной Европы.

Полиморфизмминисателлита 3’АPOВ исследован в двадцати шестипопуляциях восточно-европейского региона.Полученные данные в виде частот аллельныхвариантов в изученных популяцияхпредставлены в таблице 1. Выявлен 31аллельный вариант минисателлита 3’АPOВ с размерами от 24до 54 повторов и с различной частотой впопуляциях. Как правило, два аллельныхварианта –содержащие 34 и 36 повторов, встречаютсямаксимально часто (суммарная частота ихвстречаемости равна 57-77%), один или двааллельных варианта встречаются реже(обычно это вариант, содержащий 32, 46 или 48повторов с частотами до 12%), остальныеаллели встречаются с частотой менее 5%.Аллель 36 преобладает в европеоидныхпопуляциях восточных славян: русских,белорусов, украинцев, аллель 34 – в монголоидныхпопуляциях калмыков и якутов. На рис. 1 вкачестве примера приведены распределенияаллельных вариантов в трех популяциях,относящимся к разным антропологическимтипам –европеоидному (русские), монголоидному(якуты), и уральскому (башкиры). Соотношениечастот аллелей 34 и 36 в популяциях различныхрас является неодинаковым, что заметно присравнении монголоидных и европеоидныхпопуляций. Например, частота аллеля 34 впопуляции якутов в 2 раза выше, чем впопуляциях русских, а частота аллеля 36– в 4 разаменьше. Для уральской популяции башкирхарактерны промежуточные междуевропеоидными и монголоидными величинычастот этих аллельных вариантов. Подобныеособенности спектра распределенияаллельных частот маркера у народов разныхрас принято называтьрасово-диагностическими.

Рисунок 1. Диаграммараспределения частот аллельных вариантовминисателлитного локуса 3’АРОВ в трехпопуляциях народов различной расовойпринадлежности.

Наблюдаемый уровеньгетерозиготности по минисателлиту 3’АРОВ оказался высок;наиболее высокие значениягетерозиготности характерны для популяцииукраинцев Львова и абхазов - 0,87, наименьшеезначение гетерозиготности выявлено убашкир Белорецкого района - 0,68.Распределение частот генотиповминисателлита 3’АРОВ соответствует ожидаемому впредположении равновесия Харди-Вайнбергаво всех популяциях.

Анализ статистическойдостоверности различий междураспределениями частот аллельныхвариантов минисателлита 3’АРОВ в популяцияхВосточной Европы показал достоверныеотличия распределения частот аллельныхвариантов монголоидных популяций калмыкови якутов, а также популяций мари и башкир отвсех других исследованных популяций.

На графике многомерногошкалирования по данным изменчивостиминисателлитного локуса 3’АРОВ в популяцияхВосточной Европы (рисунок 2) прирассмотрении первой размерности следуетотметить, что основная группа популяций(европеоидные и смешанные популяции)сосредоточена в области начала отсчетакоординат, в то время как монголоидныепопуляции калмыков и якутов заметноудалены от нее. Принимая во внимание вторуюразмерность,

Рисунок 2. График многомерногошкалирования изменчивостиминисателлитного локуса 3’АРОВ в популяцияхВосточной Европы.

Сокращения: Ош – Ошевенское, Холл– Холмогоры,Костр –Кострома, Н –Новгород, Л –Львов, БС –Белая Слуда, К – Курск, Каз – кубанские казаки, Хой – Хойники, Нес – Несвиж, Ш – адыгейцы-шапсуги, А– адыгейцычерноморского побережья, АдГ - адыгейцыгорных районов.

можно выделить следующиегруппы: восточнославянские популяции,уральские популяции, адыго-абхазскиепопуляции. Восточнославянские популяцииобразуют основной кластер, внутри которогоможно отметить отдельные группы русских,украинцев и белорусов. В непосредственнойблизости от кластера восточнославянскихпопуляций находится популяциякоми-пермяков, а также две популяцииадыгейцев: адыгейцы-шапсуги и адыгейцыЧерноморского побережья. Популяциичеркесов, абхазов и адыгейцев горныхрайонов образуют другой кластер, апопуляции башкир и марийцев – третий.

Полиморфизмминисателлитного локуса D1S80 в популяцияхВосточной Европы.

Полиморфизмаминисателлита D1S80 изучен в тридцатичетырех популяциях. Полученные данные ввиде частот аллельных вариантов визученных популяциях представлены втаблице 2. Выявлен 27 аллельный вариантминисателлита D1S80 с размерами от 15 до более,чем 41 повтора. Распределение частоталлельных вариантов D1S80 являетсямультимодальным. Как правило, триаллельных варианта – с числом повторов 18, 24 и 31,встречаются максимально часто (суммарнаячастота их встречаемости составляет от 50до 75%), несколько аллельных вариантоввстречаются реже (обычно это вариант,содержащий 22, 25, 28, или 30 повторов счастотами до 11%) остальные аллели, какправило, встречаются с частотой менее 5%.

На рис. 3 в качествепримера взяты распределения частот из трехпопуляций, относящихся к разнымантропологическим типам – европеоидному(русские Смоленска), монголоидному (якуты),и уральскому (башкиры). Как и в случаеминисателлита 3’АРОВ, профили распределения частоталлельных вариантов у русских и якутовзначительно отличаются друг от друга,профиль частот башкир отражаетпромежуточные характеристики (рисунок 3).Аллель 24 преобладает в европеоидныхпопуляциях восточных славян, аллель 18 - вмонголоидных популяциях калмыков и якутов.Частота аллеля 18 в популяции якутов в 1,3раза выше, чем в популяциях русских, ачастота аллеля 24 – в 1,5 раза меньше. Что касаетсяаллеля 31, то вевропеоидных популяциях его частотанаходится на низком уровне, длямонголоидов характерны средние значениячастоты, а максимальная обнаружена впопуляциях Волго-Уральского региона.Спектр аллелей в европеоидных,монголоидных и уральских популяциях имеетобщие максимумы, однако изменение частотыотдельных аллелей бывает настолькозначимо, что меняет модальностьраспределения частот аллельных вариантов.Например, аллельный вариант 36 в популяциикалмыков имеет частоту 9%, в популяциибашкир Белорецкого района 7,5%; аллельныйвариант 29 в популяции мордва-эрзя имеетчастоту 7%; аллельный вариант 16 вмонголоидных популяциях калмыков и якутовимеет частоты 10% и 8% соответственно, впопуляциях башкир Белорецкого иАбзелиловского районов 4%.

Уровень наблюдаемойгетерозиготности минисателлита D1S80оказался еще выше, чем в случаеминисателлита 3’APOB; в популяции башкир Белорецкогорайона значение гетерозиготностидостигает 0,95, наименьшее значениегетерозиготности выявлено у украинцевКиева - 0,69. Распределения частот генотиповминисателлита D1S80 соответствуетожидаемому в предположении равновесияХарди-Вайнберга во всех популяциях.

Анализ статистическойдостоверности различий междураспределениями частот аллельныхвариантов минисателлита D1S80 показалстатистически достоверное отличие этогораспределения в популяциях разных рас. Всравнении с минисателлитом 3’АРОВ, дляминисателлита D1S80 наблюдается

Рисунок 3. Диаграммараспределения частот аллельных вариантовминисателлитного локуса D1S80 в популяцияхнародов.различной расовойпринадлежности.

более сложная картина покритерию достоверности различий междупопуляциями.

Достоверность различийобнаружена между распределениями частоталлельных вариантов монголоидныхпопуляций калмыков и якутов – от всехисследованных популяций, за исключениемсходства распределений якутов, калмыков ибашкир Белорецкого района. Распределениячастот аллельных вариантов в популяцияхмарийцев, удмуртов, коми-пермяков такжеотличаются от всех исследованныхпопуляций, однако популяции северныхрусских показывают высокую степеньсходства с этими народами. Распределения вгруппе башкирских популяций обнаруживаетвысокую внутригрупповую гетерогенность.Большая степень гомогенности наблюдаетсядля распределений частот аллельныхвариантов среди популяций восточныхславян: лишь в северных популяциях русскихОшевенского, Белой Слуды, Новгород(Парфино) обнаружены статистическидостоверные различия распределений частоталлельных вариантов от таковых в рядедругих восточнославянских популяций.

Pages:     | 1 || 3 | 4 |   ...   | 12 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»