WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |   ...   | 12 |

На правах рукописи

Вербенко ДмитрийАнатольевич

Полиморфизмминисателлитных маркеров 3’АРОВ и D1S80

в популяциях ВосточнойЕвропы

Специальность: 03.00.15–генетика

03.00.26 –молекулярная генетика

Автореферат

диссертации на соисканиеученой степени

кандидата биологическихнаук

МОСКВА

2008

Работа выполнена в отделемолекулярных основ генетикичеловека

Учреждения Российской академиинаук Институт молекулярной генетикиРАН

Научный руководитель:

доктор биологических наук,профессор Лимборская СветланаАндреевна

Официальные оппоненты:

доктор биологических наук,профессор Сулимова Галина Ефимовна

кандидат биологических наукКуприянова Наталья Сергеевна

Ведущая организация:

ФГУП «Государственныйнаучно-исследовательский институтгенетики и селекции промышленныхмикроорганизмов»

Защита диссертации состоится 1октября 2008 года в __ часов на заседанииДиссертационного совета Д 002.238.01 приУчреждении Российской академии наукИнститут биологии развития им. Н.К.КольцоваРАН по адресу: 119334, г. Москва, ул. Вавилова д.26

С диссертацией можноознакомиться в библиотеке УчрежденияРоссийской академии наук Институтбиологии развития им. Н.К.Кольцова РАН поадресу: 119334, г. Москва, ул. Вавилова д.26

Автореферат разослан «___»августа 2008 года

Ученый секретарь

Диссертационного совета

канд. биол. наук Абрамова Е.Б.

ОБЩАЯХАРАКТЕРИСТИКА РАБОТЫ

Актуальностьпроблемы

Гипервариабельныерайоны генома нашли широкое применение вкачестве генетических маркеров приизучении генома человека. Данные локусыоказались высокоинформативными маркерамидля генетического картирования, изучениягенетической гетерогенности популяций,проведения судебно-медицинскойэкспертизы, в установлении родства, а такжев экологических исследованиях.

Одним из наиболее частоиспользуемых в популяционныхисследованиях является гипервариабельныйминисателлитный локус D1S80 (рМСТ 118),расположенный в коротком плече хромосомы1. Длина элементарного звена тандемноорганизованного повторяющегося участкамаркера составляет 16 пар нуклеотидов (п.н.).В гене аполипопротеина В обнаруженвысокополиморфный участок на расстоянии 500пар оснований после 3'-конца гена.Повторяющимся звеном минисателлитногомаркера 3’АРОВявляется тандем двух последовательностейдлиной 14 и 16 п.н.

Исследованиягипервариабельных минисателлитныхлокусов 3’АроВ и D1S80 активнопроводятся во многих популяциях, благодарячему стало возможным использование этихданных для анализа эволюционныхмеханизмов, объясняющих современнуюизменчивость популяций человека.Общеизвестно, что данные по анализуматеринских и отцовских линий популяцийвсего мира прямо указывают на расселениесовременных популяций из Африки.Проведенный недавно сравнительный анализданных изменчивости минисателлита D1S80 иминисателлита 3’АРОВ в популяциях всего мира еще разподтвердил эту гипотезу [Herrera et al., 2004;Destro-Bisol et al., 2000]. Однако, до начала данногоисследования, популяции Восточной Европыпо этим типам маркеров былиохарактеризованы лишь частично.

Территория СевернойЕвразии представляет особый интерес дляпопуляционных исследований, посколькудолгое время являлась местом контактанародов монголоидной и европеоидной рас,что наложило отпечаток на формированиегенофонда современного коренногонаселения этого региона: здесь проживаетмножество смешанных народов, несущих всебе в разной пропорции признаки обеих рас.Изучение популяций, населяющих этутерриторию, является частью всемирныхисследований по изучению генетическойразнообразия населения планеты, чтоподчеркивает важность и актуальностьнастоящей работы.

Цели и задачиисследования

Целью работы являлосьизучение полиморфизма минисателлитныхмаркеров ДНК 3’AРОB и D1S80 в популяциях ВосточнойЕвропы, относящихся к разным расам иразличным этническим группам (русские,украинцы, белорусы, адыгейцы, абхазы,черкесы, калмыки, башкиры, коми).

Основные задачи длядостижения поставленной цели былиследующие:

  • изучить аллельное и генотипическоеразнообразие минисателлитных локусов ДНК3’AРОB и D1S80 впопуляциях восточно-европейского региона;
  • определить параметры полиморфизма(внутрипопуляционной изменчивости,гетерозиготности) минисателлитных локусов3’AРОB и D1S80;
  • на основании полученных данныхпровести характеристику филогенетическойвзаимосвязи популяций региона ВосточнойЕвропы с использованием методамногомерного шкалирования генетическихрасстояний;
  • оценить свойства минисателлитныхлокусов 3’AРОB иD1S80 для дифференцировки популяций наразных уровнях организации (расовый,этнический, локальный);
  • выявить филогенетическиевзаимосвязи народов Восточной Европы присовместном анализе полиморфизма маркеров,обладающих структурой тандемных повторов:минисателлитных локусов 3’AРОB и D1S80, а такжемикросателлитных локусов DM, DRPLA, SCA1, исопоставить их с характеристиками, полученными в ходеанализа каждого из минисателлитныхлокусов 3’AРОB иD1S80 в отдельности;
  • соотнести полученные картиныфилогенетических взаимосвязей популяцийВосточной Европы с результатамиисследований маркеров ДНК других типов(мтДНК, Y-хромосома, полиморфизм типаинсерция-делеция, однонуклеотидныйполиморфизм).

Научная новизна ипрактическая ценность работы

Впервые в большом числепопуляций России и Белоруссииохарактеризованы параметры изменчивостиминисателлитных маркеров 3’АРОВ и D1S80.Продемонстрированырасово-диагностические свойстваминисателлитных маркеров 3’AРОB и D1S80 приисследовании различных в этническомотношении популяций, населяющихтерриторию Северной Евразии.

Высокаядифференцирующая способностьминисателлитных маркеров 3’АРОВ и D1S80 определенане только для популяций разных рас, но и дляблизко родственных, относящихся к однойэтнической группе.

Обнаружено соответствиегенетической дифференциации изученныхпопуляций, оцениваемых как по каждому изиспользуемых маркеров, а также с помощьюпяти гипервариабельных маркеров DM, DRPLA, SCA1,D1S80, 3’AРОB.

Подтвержденаэффективность использованияминисателлитных маркеров 3’АРОВ и D1S80 дляисследования эволюционной траекториипопуляций Восточной Европы.

Апробация работы

Работа былаапробирована на лабораторном семинаре вотделе молекулярных основ генетикичеловека (ОМОГЧ) ИМГ РАН, на учёном советеИМГ РАН и генетическом семинаре Институтебиологии развития им. Н.К.Кольцова РАН.Данные, представленные в работе,докладывались на II и III Cъезде Вавиловскогообщества генетиков и селекционеров(Санкт-Петербург, 2000; Москва, 2004), II (4) и III (5)российском Cъезде медицинских генетиков(Курск, 2000; Уфа, 2005), Первом международномрабочем совещании: "Биоразнообразие идинамика экосистем Северной Евразии:информационные технологии имоделирование" (Новосибирск, 2001), IIIКонгрессе этнографов и антропологовРоссии (Москва, 1999), международномcимпозиуме "Молекулярные механизмыгенетических процессов и биотехнология"(Минск, 2001), международной конференции«Антропология на пороге III тысячелетия»(Москва, 2002), Конференциях «Памяти ГрегораМенделя» и Второй научной конференцииМосковского общества генетиков иселекционеров (Москва, 2001; Москва, 2002), XIII иXIV зимних международных молодежных научныхшколах "Перспективные направленияфизико-химической биологии ибиотехнологии" (Москва, 2001, 2002), школах пофизико-химической биологии«Биология-наука XXI века» (Пущино, 2000, 2003), IIРоссийской конференции молодых ученыхРоссии с международным участием«Фундаментальные науки и прогрессклинической медицины» (Москва, 2001),Пироговских студенческих научныхконференциях (Москва, 2002, 2003), конференцияхмолодых ученых, аспирантов и студентов помолекулярной биологии и генетике (Kiev, Ukraine,2003, 2007), конференциях Американского (AmericanSociety of Human Genetics, 1998, 1999, 2000, 2001, 2002, 2003) иЕвропейского общества генетиков человека(European Society of Human Genetics, 2000, 2002, 2003, 2004, 2005) DualCongress (Joint Meeting of Assotiations of Human Palaeontology and HumanBiologists) (South African Republic, Johannesburg, 1998), 13th Congress ofEuropean Anthropological Association (Zagreb, Croatia, 2002), InternationalAnthropological Congress “Anthropology and Society” (Prague, CheczRepublic, 2003), 14th Congress of European Anthropological Association “Humanvariability: A bridge between Sciences and humanities” (Komotini, Greece,2004), 10th International Congress of Human Genetics (Vienna, Austria, 2001),Human Genome Meetings (Turin, Great Britain, 1998; Brisbaine, Australia, 1999;Vancouver, Canada, 2000; Edinburg, Schotland, 2001; Shankhai, China, 2002),Meetings on Human Origins and Disease (Cold Spring Harbor, New York, USA, 2000,2002), The Second European-American Intensive Course in Clinical and ForensicGenetics (Dubrovnik, Croatia, 2001), The Third European-American IntensiveCourse in clinical and forensic genetics (Zagreb, Croatia, 2003), IIInternational Conference «Biosphere origin and Evolution» (Loutraki, Greece,2007), изложены на конкурсах работ настипендию фонда «Будущее молекулярнойгенетики» (Москва, ИМГ РАН, 2003 и 2005гг.).

Структура и объемдиссертации

Диссертационная работаизложена на 131 странице машинописноготекста и состоит из следующих разделов:«Введение», «Обзор литературы», «Материалыи методы», «Результаты», «Обсуждениерезультатов», «Выводы», «Списоклитературы» и приложения. Библиографиявключает 234 источника. Работаиллюстрирована 16 рисунками и содержит 16таблиц.

Публикации

По материаламдиссертации опубликована в 61 печатнаяработа, в том числе – семь статей в ведущих рецензируемыхжурналах, одна монография и 53 тезисаматериалов конференций.

СОДЕРЖАНИЕ РАБОТЫ

Полиморфизмгипервариабельного минисателлитногомаркера 3’-концевой области генааполипопротеина В (минисателлита 3’АPOВ) и минисателлитаD1S80 проанализирован в популяциях ВосточнойЕвропы. Изучены этнические группы какевропеоидов (русские, белорусы, кубанскиеказаки, адыгейцы, шапсуги, черкесы, абхазы)так и монголоидов (якуты, калмыки).Популяция якутов, населяющих центральныйрегион Сибири, была взята в анализ какконтрастная популяция монголоидов. НародыВолго-Уральского региона (коми, удмурты,башкиры, мари) характеризуютсяантропологами как этнические группы сразличной степенью соотношенияевропеиодного

Таблица 1. Описание популяций.

Лингвистическаяклассификация

Этническая

принадлежность

Условное

обозначение

Географическое

положение

Лингвистическая семья

Лингвистическая группа

1.

Индо-европейская

Восточно-славянская

Русские

Знаменка

Смоленская обл., г.Угра

2.

Холмогоры

Архангельская обл.,г. Холмогоры

3.

Ошевенское

Архангельская обл.,Каргопольский р-н

4.

БелаяСлуда

Архангельская обл.,Красноборский р-н

5.

Курск

Курская обл.,Курский р-н

6.

Новгород

Новгородская обл.,п. Парфино

7.

Кострома

Костромская обл.,Костромской р-н

8.

Кубанскиеказаки

Краснодарскийкрай, г. Краснодар

9.

Белорусы

Хойники

Респ. Белоруссия,Гомельская обл., Хойникский р-н

10.

Несвиж

Респ. Белоруссия,Минская обл., Несвижский р-н

11.

Гродно

Респ. Белоруссия,Гродненский р-н

12.

Бобруйск

Респ. Белоруссия,г.Бобруйск

13.

Пинск

Респ. Белоруссия,Пинский р-н

14.

Мядель

Респ. Белоруссия,Минская обл., Мядельский р-н

15.



Украинцы

Киев

Респ. Украина,Киевский р-н

16.

Львов

Респ. Украина,Львовский р-н

17.

Алчевск

Респ. Украина,Луганская обл., Алчевский р-н

18.

Уральская

Угро-Финская

Коми-пермяки

Коми

Пермский край,Пермский р-н

19.

Pages:     || 2 | 3 | 4 | 5 |   ...   | 12 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»