WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 |   ...   | 4 | 5 || 7 |

Клетки размером 0,3-0,4 х 1,7-2,8 µm, подвижные. Споры не образуют. Колонии ярко-красного цвета, округлые, каплевидные, блестящие, гладкие диаметром 5-6 мм. Грамотрицательные, оксидазо-положительные и каталазо-отрицательные клетки. Строгий аэроб, гало-, алкалотолерантный и мезофильный организм. Рост отмечен в диапазоне концентраций NaCl от 0 до 7,5 %, с оптимумом 3 %, рН 6,5–11, оптимумом 7,7 и температуры 13 - 42 °C с оптимумом 37°C. Не отмечен рост в анаэробных условиях. Не продуцирует кислоту из D-глюкозы. Не редуцирует нитрат до нитрита. В качестве субстратов использует глицерин, D-глюкозу, сахарозу, рамнозу, глутамат, пептон, дрожжевой экстракт, крахмал, L-аспарагин, L-орнитин, пируват, ацетат, гидролизат казеина и РПА. Не утилизирует цистеин, L-лизин, гликолят, цитрат, лактат, метанол, сукцинат, тартрат, D-маннит, D-сорбит и углеводороды. Доминирующие жирные кислоты iso 15:0 (56,3 %); 10 Me16 (11,5%); iso 15:1 (7,8%); 16:1w7 (4,3%); 15:0 iso 2-OH (2,8%). Содержание ГЦ в ДНК 29,8 мол.%.

Типовой штамм Sk1 депонирован в коллекции культур DSZM под номером DSM 18439. Местообитание и выделение: донные осадки содового оз. Соленое (Южное Забайкалье).

Таблица 5.

Признаки

Размер клеток (мкм)

Содер

жание ГЦ в ДНК

(mol %)

pH

NaCl (%)

t°C

l-орнитин

d-рибоза

l-арабиноза

Лактоза

Каприлат

Целлюлоза

Доминирующие жирные кислоты (%):

lim

opt

lim

opt

lim

opt

15:0 iso

10 Ме16

16:1w7c/

15:0 iso 2-OH

15:0 ante

iso

SK1

0,3-0,4x

1,7-2,8

29.8

6,5-11

7,7

0-7,5

3

13-42

37

56,34

11,51

7,08

0,9

Nu

0,4-0,5x

1,1-1,7

42,7

6,5-10

7,6

0-7,5

0,5-1,5

13-42

25

+

+

+

+

49,73

9,36

8,24

3,5

Отличительные признаки у выделенных штаммов Sk1 и Nu

Описание «Sanguinoglea alkalitolerans» gen. nov., sp. nov.

Клетки размером 0,4-0,5x1,1-1,7 µm, подвижные, споры не образуют. Колонии красного цвета, округлые, блестящие, выпуклые, гладкие, диаметром 4-5 мм. Грамотрицательные, оксидазо-положительные и каталазо-отрицательные клетки. Строгий аэроб, гало-, алкалотолерантный и мезофильный организм. Рост отмечен в диапазоне NaCl от 0 до 7,5 %, с оптимумом 0,5-1,5%, pH 6,5–10 с оптимумом pH 7,6, и температуры 13–42 °C, с оптимумом 25 °C. В анаэробных условиях рост не наблюдается. Не продуцирует кислоту из D-глюкозы. Не редуцирует нитрат до нитрита. Используемыми субстратами являются глицерин, D-глюкоза, сахароза, рамноза, глутамат, каприлат, L-арабиноза, лактоза, пептон, дрожжевой экстракт, крахмал, L-аспарагин, L-орнитин, пируват, ацетат, гидролизат казеина и РПА. Не утилизирует цистеин, L-лизин, гликолят, цитрат, лактат, метанол, сукцинат, тартрат, D-маннит, D-сорбит и углеводороды. Доминирующие жирные кислоты iso 15:0 (48,7 %); 10Me16 (9,4%); iso 15:1 (7,09%); 16:1w5 (4,09%); a 15 (3,5%); a 17:1 (3,3%). Содержание ГЦ в ДНК 42,7 мол.%.

Типовой штамм Nu депонирован в коллекции культур DSZM под номером DSM 18440. Местообитание и выделение: донные осадки содового оз. Нухэ-Нур.

Предложенные новые таксоны и их названия в настоящее время еще не утверждены, так как проходят стадию, необходимую для официальной валидации.

Рис. 5. Филогенетическое дерево последовательностей штаммов Nu и Sk1 в системе семейства Flexibacteriaceae. Построено на основе анализа фрагмента гена 16S рРНК с помощью метода объединения ближайших соседей (NJ). Вероятностная поддержка отдельных узлов оценивалась с помощью бутстрэп-анализа, приведены значения выше 80%. Шкала соответствует 0,1 нуклеотидных замен на сайт.

ЗАКЛЮЧЕНИЕ

В галоалкалофильном микробном сообществе стадия деструкции органического вещества осуществляется как в анаэробных, так и аэробных условиях. Высокая численность аэробных и анаэробных бактерий-деструкторов выявлена нами в иловых отложениях содовых озер. В момент исследований наибольшее содержание органического вещества и наибольшая численность бактерий наблюдались в поверхностных и подповерностных слоях донных отложений.

Микробные сообщества исследованных щелочных озер с невысокой степенью минерализации оказались более разнообразны по морфологии бактерий, чем высоко минерализованные озера.

Среди выделенных нами как в условиях интенсивной аэрации, так и культивированных в стационарном состоянии бактерий-деструкторов большая часть оказалась факультативными анаэробами. По-видимому, возможность переключения метаболизма с аэробного на анаэробный дает им преимущество в сообществе при смене экологических условий. Бактерии отличаются широкой метаболической активностью в отношении используемых субстратов и в микробном сообществе донных отложений исследуемых озер являются активными участниками деструкции органического вещества.

Среди определенных с помощью молекулярно-генетических методов бактерий выявлены представители космополитного р. Bacillus и р. Halomonas, характерного как для соленых, так и для щелочных мест обитания.

Бациллы функционально являются группой, способной в микробном сообществе содовых озер осуществлять гидролиз различных органических соединений (белка, сахаров, липидов). Галомонады, обладая универсальным метаболизмом, используют низкие концентрации органических соединений. Ферментативная активность штаммов Д1, К5, К6, 17п, определенная в отношении ряда субстратов, ограничена использованием углеводов и аминокислот. Таким образом, эти культуры в сообществе занимают функциональное положение диссипотрофов, использующих низкомолекулярные вещества.

Впервые из содовых озер выделены алкало- и галотолерантные аэробные представители бактерий группы Cytofaga-Flexibacteria-Bacteroides, хотя наличие бактерий этой группы неоднократно подтверждалось при изучении микробных сообществ содовых озер молекулярно-генетическими методами (содовые озера Кении (Rees et al., 2004), нуклеотидные последовательности из Моно Лэйк (Калифорния), гиперсоленые озера на Гавайях, и др., зарегистрированные в GENBANK), а анаэробный представитель - Alkaliflexus imshenetskii - был получен в культуре ранее (Zhilina et al., 2004). Выделенные нами чистые культуры бактерий этой группы представляют новые роды и виды семейства Flexibactericeae, с предложенными названиями «Lyalikoviella elongate» gen. nov., sp. nov. и «Sanguinoglea alkalitolerans» gen. nov., sp. nov.

Выводы:

  1. В исследованных содово-соленых озерах Забайкалья с минерализацией воды от 5,6 до 320 г/л и рН воды 7,7-10 создаются благоприятные условия для развития функционально разнообразного микробного сообщества алкало- и галотолерантных / -фильных организмов.
  2. Количество аэробных органотрофных бактерий в донных отложениях содово-соленых озер варьирует от 10 тыс. до 100 млн. кл/мл и анаэробных органотрофных бактерий – от 10 тыс. до 10 млн. кл/мл, что свидетельствует об активном участии микробного сообщества в процессе деструкции органического вещества.
  3. Среди выделенных в аэробных условиях в чистые культуры бактерий-деструкторов различных физиологических групп большая часть относится к факультативно-анаэробным, что позволяет им осуществлять деструкцию органического вещества при смене экологических условий в экосистеме.
  4. Сиквенс генов 16S р-РНК штаммов, отобранных по принципу доминирующих видов и пигментации, показал сходство на уровне 96-100% с уже описанными видами р. Bacillus, Halomonas, Oceanobacillus.
  5. Из содово-соленых озер Соленое и Нухэ Нур выделены два строго аэробных алкало- и галотолерантных штамма, отнесенных нами к новым родам и видам семейства Flexibactericeae, к группе Cytophaga-Flavobacterium-Bacteroides, с предложенными названиями «Lyalikoviella elongate» gen. nov., sp. nov. и «Sanguinoglea alkalitolerans» gen. nov., sp. nov.
  6. Выделенные как доминирующие при изоляции и новые штаммы факультивно-анаэробных бактерий-деструкторов отличаются высокой метаболической активностью в отношении используемых субстратов и обладают широким спектром гидролитических ферментов.

Список работ, опубликованных по материалам диссертации:

  1. Чагдурова Т.Н. (Митыпова) Функциональное разнообразие бактерий-деструкторов органического вещества в донных осадках содово-соленых озер Забайкалья / Т.Н. Чагдурова, Л.П. Козырева // Биология – наука ХХI века. 8-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых.– Пущино, 2004. – С. 165
  2. Чагдурова Т.Н. Микробное сообщество содовых и содово-соленых озер Забайкалья / Т.Н. Чагдурова, Л.П. Козырева // Материалы 4-й региональной научной конференции «Научный и инновационный потенциал байкальского региона глазами молодежи», Улан-Удэ: Изд-во БГУ, 2004. – С.76-78
  3. Чагдурова Т.Н. Амилолитические бактерии в донных отложениях содово-соленых озер Забайкалья / Т.Н. Чагдурова, Л.П. Козырева // Материалы межрегиональной научно-практической конференции «Биология микроорганизмов и их научно-практическое использование», Иркутск: изд-во ИГУ, 2004. – С. 180-181
  4. Чагдурова Т.Н. Структура и функциональная активность микробного сообщества содово-соленого озера Соленое (Южное Забайкалье) // Материалы VIII Международной школы-конференции студентов и молодых ученых 24-27 ноября «Экология Южной Сибири и сопредельных территорий», Абакан: изд-во Хакасского государственного университета им. Н.Ф. Катанова, 2004. – Т.1. – С. 147-148
  5. Митыпова Т.Н. Аэробные и анаэробные бактерии-деструкторы органического вещества в донных осадках содово-соленых озер Забайкалья / Т.Н. Митыпова, Л.П. Козырева, Б.Б. Намсараев // Вестник Бурятского университета. Серия. 2: Биология. Выпуск 7. – Улан-Удэ: Изд-во БГУ, 2005. – С. 190-193
  6. Митыпова Т.Н. Функциональная активность целлюлозоразлагающих бактерий в донных осадках содово-соленого оз. Соленое (Южное Забайкалье) / Т.Н. Митыпова, Л.П. Козырева // Биология – наука ХХI века. 9-я Международная Пущинская школа-конференция молодых ученых.– Пущино, 2005. – С. 18-19
  7. Митыпова Т.Н. Гидрохимическая и микробиологическая характеристика оз. Соленое (Южное Забайкалье) / Т.Н. Митыпова, Л.П. Козырева // Материалы 5-й региональной научно-практической конференции 27 апреля «Научный и инновационный потенциал байкальского региона глазами молодежи», Улан-Удэ: изд-во БГУ, 2005. – С.52-55
  8. Митыпова Т.Н. Физиолого-биохимическая характеристика аэробных бактерий-деструкторов, выделенных из содовых озер Забайкалья // Актуальные аспекты современной микробиологии. Молодежная школа-конференция 1-3 ноября, Москва. М.: МАКС Пресс, 2005. – С. 45-46
  9. Митыпова Т.Н. Сезонные изменения органических веществ в донных отложениях содово-соленого оз. Соленое (Киран) // Сборник трудов аспирантов и молодых ученых БГУ. – Улан-Удэ: Изд-во БГУ, 2006. – С. 7-9
  10. Митыпова Т.Н. Новые гало- и алкалофильные бактерии, выделенные из содово-соленых озер Забайкалья / Т.Н. Митыпова, Л.П. Козырева, З.Б. Намсараев // Тезисы Всероссийской конференции с международным участием «Биоразнообразие экосистем Внутренней Азии».– Улан-Удэ: Изд-во БНЦ СО РАН, 2006. – С.63-64
  11. Митыпова Т.Н. Сравнительная характеристика новых родов облигатно аэробных бактерий из содовых озер Бурятии / Т.Н. Митыпова, Л.П. Козырева, З.Б. Намсараев // Актуальные аспекты современной микробиологии. Молодежная школа-конференция 1-3 ноября, Москва. М.: МАКС Пресс, 2006. – С. 63-64
  12. Митыпова Т.Н. Роль алкалофильных/толерантных и галофильных/толерантных бактерий из содовых озер Забайкалья в деструкции органического вещества / Т.Н. Митыпова, Л.П. Козырева, З.Б. Намсараев // Экология в современном мире: взгляд научной молодежи: тезисы Всероссийской конференции молодых ученых. – Улан-Удэ: Изд-во БНЦ СО РАН, 2007. – С. 190
  13. Митыпова Т.Н. Функционирование микробного сообщества оз. Соленое / Т.Н. Митыпова, Л.П. Козырева, В.Б. Дамбаев // Экология в современном мире: взгляд научной молодежи: тезисы Всероссийской конференции молодых ученых. – Улан-Удэ: Изд-во БНЦ СО РАН, 2007. – С. 188-189
  14. Митыпова Т.Н.
    Pages:     | 1 |   ...   | 4 | 5 || 7 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»