WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 || 3 | 4 |

Данные по содержанию трех типов эндогенных ретровирусов (env A, env B и env C) у домашних свиней разных пород и двух подвидов диких кабанов в зависимости от условий их содержания и обитания приведены в таблице 1. Анализ распределения частот носителей PERV у диких и домашних свиней показал, что в целом по виду Sus scrofa, а так же для дикой и домашней формы, имеют место статистически значимые различия частот носителей разных типов ретровируса. Наиболее часто встречаются носители PERV env A, с несколько меньшей частотой – носители env B, самую низкую частоту имеют носители env C. Дикая и домашняя формы вида Sus scrofa весьма существенно различаются как по частотам носителей PERV, так и по выраженности различий между этими частотами: частоты носителей выше у домашних свиней, а выраженность различий типов PERV - у диких кабанов. Пределы, в которых варьируют выборочные частоты носителей PERV, различны для разных типов ретровируса. Для носителей эндогенного ретровируса типа env A в целом по виду 50–100%, для диких кабанов 50–74.2%, у домашних свиней 80–100%. Таким образом, области вариации частот носителей этого типа у дикой и домашней формы не перекрываются. Для носителей env B в целом по виду 25–100%, из них для диких кабанов 25–67.7%, у домашних свиней 40–100%, то есть области вариации перекрываются. PERV C в целом по виду у диких кабанов 12.9–100%, а у домашних свиней 17.2–98.8%. То есть в последнем случае область вариации выборочных частот у домашних свиней лежит внутри области вариации диких кабанов. Таким образом, имеет место достоверное отличие домашней и дикой

Таблица 1. Наличие эндогенных ретровирусов разных типов в популяциях домашних свиней и диких кабанов.

Порода (подвид)

Хозяйство и

место обитания

Объём выборки

env A+

env B+

env C+

число

%

число

%

число

%

Мини-свиньи

СО РАН

160

158

98,75

157

98,13

158

98,75

Ландрас

СО РАН

30

29

96,67

29

96,67

25

83,33

Ландрас

Кудряшевский

15

12

80,00

10

66,67

3

20,00

Дюрок

Кудряшевский

10

8

80,00

4

40,00

2

20,00

КБ, новосибирский тип

Иня

99

92

92,93

83

83,84

17

17,17

КБ, ачинский тип

Иня

101

93

92,08

100

99,01

40

39,60

СМ-1

Тулинский

21

21

100

21

100

16

76,19

Кабан Юга Украины

Украина

31

23

74,20

21

67,70

4

12,90

Среднеазиатский

кабан

Киргизия

4

2

50,00

1

25,00

4

100

Всего

471

438

92,99

426

90,45

269

57,11

Домашние свиньи

436

413

94,70

404

92,70

261

59,90

Дикие кабаны

35

25

71,40

22

62,90

8

22,90

2 (дикая и домашняя форма)

26,99

33,30

18,11

Примечание: КБ – крупная белая порода, СМ-1 - скороспелой мясной породы

формы свиней по встречаемости у них ретровирусов разных типов.

Карта, построенная в пространстве двух главных компонент по частотам носителей различных типов PERV в выборках диких и домашних свиней (рис. 2), позволяет выделить четыре кластера:

I. среднеазиатский кабан;

II. кабан Южной Украины, свиньи пород ландрас и дюрок ОАО

"Кудряшовское" и новосибирский тип крупной белой породы из

ЗАО АПК "Иня";

III. ачинский тип крупной белой породы из ЗАО АПК "Иня";

IV. лабораторные мини-свиньи «Минисибс» и ландрасы из ЭХ СО РАН

и скороспелая мясная порода из учхоза "Тулинское".

Если разделить карту по диагонали, можно выделить две группы: в первую группу входит только Кластер I, в который вошел среднеазиатский кабан, во вторую - все остальные выборки. Очевидно, это связано с тем, что выборке среднеазиатского кабана присуще своеобразное соотношение частот носителей различных типов PERV. Во вторую группу вошли кластеры II, III и IV, включающие представителей пород европейского происхождения и дикого кабана Южной Украины. Кластер II – включает кабанов Южной Украины, домашних свиней пород ландрас, дюрок ОАО "Кудряшовское" и

свиней крупной белой породы новосибирского типа из ЗАО АПК "Иня". Кластер III включает только ачинский тип крупной белой породы из ЗАО АПК "Иня" и занимает промежуточное положение между кластерами II и IV. Кластер IV – это лабораторные мини-свиньи «Минисибс» и ландрасы, содержащиеся в одинаковых условиях ЭХ СО РАН, а также скороспелая

Рисунок 2. Карта взаимного расположения выборок из популяций домашних и диких свиней, живущих в различных условиях окружающей среды, построенная в пространстве двух главных компонент по встречаемости всех типов PERV.

Обозначения: белая штрих-линия – кластеры, выделенные на основании сходства; белое поле, ограниченное сплошной чёрной линией – выборки, входящие в одну генеральную совокупность; черная жирная линия соединяет выборки одной породы.

мясная порода из учхоза "Тулинское". Последний кластер объединяет животных, обладающих наиболее высокой частотой носителей всех типов ретровирусов.

По-видимому, на формирование этих кластеров оказало влияние не только генетическое родство популяций, но и сходство условий содержания/обитания. Отметим, что выборки из пород, представленных в кластере II, оказались в кластере III и IV. На карте видно, что с одной стороны, выборки одной и той же породы (ландрас, крупная белая) попали в разные кластеры, с другой, в одном кластере (IV) оказались неродственные между собой породы (ландрас, СМ-1) (рис. 2).

2. Влияние генотипа и среды на частоту носителей различных типов PERV у диких и домашних свиней.

Построенная нами карта показала, что выборки одной породы, живущие в разных условиях, оказались в разных кластерах, в то время как свиньи разных пород вошли в один кластер. Чтобы подтвердить возможное влияние генотипа и среды на встречаемость ретровирусов различных типов, была проведена оценка влияния факторов наследственности и среды на формирование частоты носителей PERV в популяциях свиней. Анализ влияния породной принадлежности и условий среды на частоту носителей PERV проводили с помощью системы из трёх однофакторных дисперсионных комплексов (Лакин, 1990). В первом из них градациями фактора выступают выборки как таковые. Таким образом, подразделение массива данных максимально и включает в себя одновременно подразделение по генетической (порода) и средовой (условия содержания) компонентам изменчивости. Во втором комплексе градациями фактора являются породы. Таким образом, подразделение проведено по генетической компоненте изменчивости. В третьем комплексе осуществлено подразделение по условиям окружающей среды (хозяйствам), то есть по средовой компоненте изменчивости (рис. 3).

Наибольшее влияние факторов наблюдается на вариацию встречаемости эндогенного ретровируса типа env C, что очевидно связано с его низкой, по сравнению с другими, частотой в популяциях. Влияние породной принадлежности и условий содержания (обитания) на вариацию частоты ретровирусов и общее разнообразие приблизительно одинаковы.

Рисунок 3. Сила влияния (2) выборки, породы и условий содержания на частоту носителей эндогенных ретровирусов разных типов по данным однофакторного дисперсионного анализа.

Наименьшее влияние изучаемые факторы оказывают на частоту типа env A, встречаемость которого в выборках максимальна; тип env B занимает промежуточное положение. Влияние выборки, т.е. совместного влияния генотипа и среды на встречаемость env В было преобладающим; отдельное влияние породной принадлежности и условий содержания (обитания) на вариацию частоты эндогенного ретровируса типов А и В приблизительно одинаково.

Результаты анализа показывают равное участие наследственности и окружающей среды в формировании частот носителей разных типов PERV. Частота особей, позитивных по тому или иному типу PERV в выборке, определяется суммарным эффектом факторов среды и наследственности. Поэтому, при подразделении массива данных на выборки (градации, включающие в себя одновременно подразделение по генетическому фактору, так и подразделение по фактору среды) мы имеем наиболее высокие значения 2 (силы влияния фактора). Влияние собственно наследственности (подразделение массива данных по породам/подвидам) и собственно среды (подразделение по месту и условиям обитания) приблизительно одинаковы.

Pages:     | 1 || 3 | 4 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»