WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 |   ...   | 2 | 3 ||

При анализе распределения генотипов полиморфного варианта A803G выявлено, что «дикий» генотипа 803АА (рис. 9) чаще встречался в подгруппе курящих больных раком легкого мужчин (52.5%) по сравнению с курящими мужчинами контрольной группы (34.1%) (2 = 4.09, p = 0.043). При этом значение ОШ = 2.13 свидетельствует об ассоциации данного генотипа с предрасположенностью к раку легкого у курящих мужчин.

Рис. 9. Распределение частот генотипов полиморфного варианта A803G гена NAT2 и аллеля 803G у курящих мужчин в группе больных раком легкого и в контрольной группе.

Проведенный сравнительный анализ распределения частот встречаемости аллелей и генотипов полиморфных вариантов C282T, C481T, G590A, A803G и G857A гена NAT2 у больных раком легкого разных гистологических типов не выявил статистически значимых различий.

Исследование ассоциаций комбинаций генотипов гена NAT2 с раком легкого у жителей г. Новосибирска

Анализ распределения частот комбинаций генотипов полиморфных вариантов гена NAT2 (рис. 10) выявил достоверные различия в частоте встречаемости комбинации 282СС/590GG/481TC/803AA/857GG в группе больных раком легкого (6.6%) по сравнению с контрольной группой (0.6%) (2 = 6.44, p = 0.005) и комбинации 282TС/590AG/481СC/803GA/857GG в группе больных раком легкого (0%) по сравнению с контрольной группой (3.6%) (2 = 2.88, р = 0.041). При этом комбинация генотипов 282СС/590GG/481TC/803AA/857GG ассоциирована с предрасположенностью к раку легкого (ОШ = 11.65), а комбинация 282TС/590AG/481СC/803GA/857GG (ОШ = 0.22 при допущении единичного случая в подгруппе больных раком легкого) ассоциирована с устойчивостью к заболеванию. Эти комбинации генотипов характеризуются наличием аллеля, содержащим С481T без A803G или во втором случае, наоборот, A803G без С481T. Известно, что в популяции европеоидов наиболее часто встречаются аллели, в которых сочетаются полиморфизмы С282Т и G590A; C481T и A803G (Barrett et al., 2003; Gaikovitch et al., 2003). Поэтому полученный факт свидетельствует о большом эпидемиологическом значении этих комбинаций.

Рис 10. Распределение частот комбинаций генотипов гена NAT2 у больных раком легкого и в контрольной группе.

1 – 282CC/590GG/481CC/803AA/857GG;

2 – 282CC/590GG/481TC/803AA/857GG;

3 – 282CC/590GG/481TC/803GA/857GG;

4 – 282CC/590GG/481TT/803GG/857GG;

5 – 282TC/590AG/481CC/803AA/857GG;

6 – 282TC/590AG/481CC/803GA/857GG;

7 – 282TC/590AG/481TC/803GA/857GG;

8 – 282TT/590AA/481CC/803AA/857GG;

9 – редкие комбинации.

Собственные результаты и данные литературы (Cascorbi et al. 1996; Wikman et al. 2001; Borlak, Reamon-Buettner, 2006) свидетельствуют о том, что на определенных территориях, под воздействием присущего им спектра (про-)канцерогенных веществ, на предрасположенность к раку легкого будут влиять определенные комбинации генотипов. У европеоидов г. Новосибирска комбинации генотипов 282СС/590GG/481TC/803AA/857GG, 282TС/590AG/481СC/803GA/857GG, а также индивидуальный полиморфизм (A803G) могут оказать влияние на предрасположенность к раку легкого. Полученные результаты свидетельствуют о целесообразности дальнейшего изучения роли полиморфизма генов ФБК в этиологии и патогенезе заболевания.

ВЫВОДЫ

1. Использование эндонуклеаз рестрикции Bse1I и HinfI позволяет однозначно определить полиморфизмы C190T и G857A гена NAT2, соответственно, а Bst4CI – полиморфизм A752T гена NAT1. Сочетанное использование эндонуклеаз рестрикции MspI, Bse1I и Bst2UI позволяет различить полиморфизмы С190Т и G191A, а эндонуклеаз BamHI, HinfI и AspS9I – полиморфизмов G857A и Т859С, 859Del гена NAT2.

2. В результате поиска методом ПДРФ-анализа с использованием эндонуклеаз рестрикции AccB1I, AluI, AspS9I, Bme18I, BstACI, Bst4CI, BstDSI, ErhI, Fsp4HI, HinfI, RsaI, SfaNI и SmiMI новых мутаций в транслируемой последовательности гена NAT2 не обнаружено.

3. Частоты встречаемости шести полиморфных вариантов гена NAT1 (C97T, C190T, G350,351C, T402C, A752T и 1025) и двенадцати полиморфных вариантов гена NAT2 (T111C, C190T, G191A, C282T, C481T, A434C, G590A, C759T, A803G, G857A, T859C, 859Del) в исследованной выборке европеоидов г. Новосибирска достоверно не отличаются от таковых в других популяциях европеоидов.

4. В европеоидной популяции г. Новосибирска отсутствует ассоциация полиморфных вариантов C282T, С481T, G590A и G857A гена NAT2 с раком легкого.

5. В европеоидной популяции г. Новосибирска аллель 803G гена NAT2 у мужчин (ОШ = 0.60; p = 0.026) ассоциирован с устойчивостью к раку легкого. Генотип 803АА у мужчин (ОШ = 1.92; р = 0.041), в том числе курящих (ОШ = 2.13; р = 0.043) ассоциирован с предрасположенностью к раку легкого.

6. Комбинация генотипов 282ТС/590АG/481СC/803GA/857GG гена NAT2 в исследованной популяции ассоциирована с устойчивостью к раку легкого (ОШ = 0.22; р = 0.041), а комбинация 282СС/590GG/481TC/803AA/857GG ассоциирована с предрасположенностью к раку легкого (ОШ = 11.65; р = 0.005).

Практические рекомендации

При проведении молекулярно-эпидемиологических исследований использование эндонуклеаз рестрикции Bse1I и HinfI позволит однозначно определить полиморфизмы C190T и G857A гена NAT2, а Bst4CI – полиморфизм A752T гена NAT1. Сочетанное использование эндонуклеаз рестрикции MspI, Bse1I и Bst2UI позволит различить полиморфизмы С190Т и G191A, а эндонуклеаз BamHI, HinfI и AspS9I – полиморфизмов G857A и Т859С, 859Del гена NAT2.

Основные результаты диссертации опубликованы в следующих работах:

  1. Никишина М.В., Макарова С.И., Акишев А.Г., Вавилин В.А., Дегтярев С.Х., Ляхович В.В. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов гена ариламин N-ацетилтрансферазы 2 у больных раком легкого // Тезисы научных докладов III съезда биохимического общества, 26 июня-1 июля 2002, С. 305-306.
  2. Никишина М.В., Акишев А.Г., Вавилин В.А., Макарова С.И., Дегтярев С.Х., Ляхович В.В. Анализ полиморфизма длин рестрикционных фрагментов гена NAT1 у европеоидов Западной Сибири // Бюлл. Эксп. Биол. Мед. – 2003. – Т. 136. – № 11. – С. 544-546.
  3. Никишина М.В. Полиморфизм гена NAT2 у здоровых и больных раком легкого жителей г. Новосибирска // Материалы Российской научно-практической конференции, посвященной 25-летию НИИ онкологии ТНЦ СО РАМН «Современное состояние и перспективы развития клинической онкологии», Томск, 24-25 июня 2004, С. 152-153.
  4. Никишина М.В. Полиморфизм генов N-ацетилтрансфераз (NAT1 и NAT2) у жителей г. Новосибирска // Материалы V молодежной научной конференции СО РАМН «Фундаментальные и прикладные проблемы современной медицины», Новосибирск, 2004, С. 138-139.
  5. Никишина М.В., Макарова С.И. Полиморфизм гена NAT2 у европеоидов Западной Сибири // Сборник тезисов 8-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых «Биология – наука XXI века», Пущино, 17-21 мая 2004, С. 22.
  6. Никишина М.В., Акишев А.Г. Рестрикционный анализ гена NAT1 у европеоидов Западной Сибири // Сборник тезисов 8-ой Международной Пущинской школы-конференции молодых ученых «Биология – наука XXI века», Пущино, 17-21 мая 2004, С. 22-23.
  7. Никишина М.В. Полиморфизм гена N-ацетилтрансферазы (NAT2) у европеоидов Западной Сибири. Выявление ассоциации с раком легкого // Материалы конкурса работ молодых ученых «Теоретические и прикладные проблемы медицинской генетики», СО РАМН, Новосибирск, 2004, С. 47-57.
  8. Никишина М.В., Акишев А.Г., Макарова С.И., Вавилин В.А., Дегтярев С.Х., Ляхович В.В. Применение эндонуклеаз рестрикции Bst2UI и Acc65I для обнаружения KpnI-полиморфизма гена NAT2 // Биомед. Хим. – 2004. – T. 50. - № 3. – С. 269-272.
  9. Никишина М.В., Макарова С.И., Акишев А.Г., Вавилин В.А., Дегтярев С.Х., Ляхович В.В. Рестрикционный анализ гена N-ацетилтрансферазы (NAT2) у европеоидов Западной Сибири // Генетика. – 2004. – Т. 40. – № 11. – С. 1557-1561.
  10. Никишина М.В., Вавилин В.А., Макарова С.И., Ляхович В.В. Анализ ассоциаций полиморфизмов гена NAT2 с риском возникновения рака легкого // Бюлл. Эксп. Биол. Мед. – 2007. – Т. 143. - № 1. – С. 89-92.

Список используемых сокращений:

Del, – делеция

Frameshift – сдвиг рамки считывания

NAT – ариламин N-ацетилтрансфераза

ORF – открытая рамка считывания

3'-UTR – 3'-нетранслируемый регион

ДНК – дезоксирибонуклеиновая кислота

ОШ – отношение шансов

п.н. – пар нуклеотидов

ПДРФ – полиморфизм длин рестрикционных фрагментов

ПЦР – полимеразная цепная реакция

ФБК – ферменты биотрансформации ксенобиотиков

Автор выражает благодарность коллективу НИИ терапии СО РАМН за предоставленную часть образцов контрольной выборки, к.б.н. Макаровой С.И. за помощь в проведении ферментативного гидролиза при поиске новых полиморфизмов в гене NAT2, а также с.н.с. Акишеву А.Г. за помощь в освоении методов и научные консультации на всех этапах работы.

Pages:     | 1 |   ...   | 2 | 3 ||






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»