WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 | 2 || 4 |

Возникновение новых сайтов узнавания в результате возможных замен в положении 709

Варианты полиморфизма

Участок последовательности

Распознающая эндонуклеаза

«Дикий» тип

Полиморфизм Т709А

Полиморфизм Т709С

Полиморфизм Т709G

5-705GGGCTTCAT

5-705GGGCАTCAT

5-705GGGCСTCAT

5-705GGGCGTCAT

SfaNI (GCATC)

AspS9I (GGNCС)

BstACI (GRCGYR)

Примечание: подчеркнуты сайты узнавания эндонуклеаз.

В исследованной выборке европеоидов мы не обнаружили новых полиморфизмов в гене NAT2. Объем исследованной выборки (79 человек, 158 аллелей) позволяет заключить, что при возможном обнаружении этих полиморфизмов в большей выборке европеоидов, они с высокой вероятностью будут относиться к категории редких мутаций.

Распределение частот встречаемости полиморфных вариантов генов NAT в контрольной выборке европеоидов г. Новосибирска

Нами проведено генотипирование по шести описанным в литературе полиморфным вариантам гена NAT1 (Deitz et al., 1997; Lin et al., 1998; Lo-Guidice, 2000) у 74 индивидуумов контрольной группы (табл. 4).

Таблица 4

Частоты встречаемости полиморфных аллелей гена NAT1 у европеоидов

г. Новосибирска в сравнении с литературными данными

Аллель

Результаты исследования

Данные литературы*, частота

Абс.

Частота

97T

0

0

0-0.015

190T

0

0

0.001-0.005

350,351C

0

0

0

402C

0

0

0-0.002

752T

1

0.007

0.004-0.006

1025

0

0

0.002

Примечание: * - Lin et al., 1998; Lo-Guidice et al., 2000; Cascorbi et al., 2001; Fronhoffs et al., 2001; Soucek et al., 2004.

Генотипирование NAT2 проведено по двенадцати описанным в литературе полиморфным вариантам (Hein et al., 2000; Anitha, Banerjee; 2003) у 167 индивидуумов контрольной группы (табл. 5).

Таблица 5

Частоты встречаемости полиморфных вариантов гена NAT2 у европеоидов г. Новосибирска в сравнении с литературными данными

Аллель

Результаты исследования

Данные литературы*, частота

Абс.

Частота

111C

0

0

-

190T

0

0

0

191A

0

0

0

282T

108

0.323

0.279-0.347

481T

137

0.410

0.388-0.442

434C

0

0

0.004

590A

110

0.329

0.268-0.317

759T

0

0

0.009

803G

137

0.410

0.395-0.428

857A

9

0.027

0.020-0.034

859C

0

0

0.003

859Del

0

0

0.003

Примечание: * - Lin et al., 1994; Brockmoller et al., 1996; Woolhouse et al., 1997; Gross et al., 1999; Anitha, Banerjee, 2003; Gaikovitch et al., 2003.

Полученные нами результаты свидетельствуют о схожей картине распределения частот встречаемости полиморфных вариантов генов NAT в Западно-Сибирской популяции европеоидов с другими европеоидными популяциями.

Исследование ассоциаций полиморфных вариантов гена NAT2 с раком легкого у европеоидов г. Новосибирска

Исследование ассоциаций проведено для полиморфных вариантов C282T, C481T, G590A, A803G и G857A гена NAT2 с раком легкого. По всем исследованным полиморфным вариантам гена NAT2 наблюдается соответствие распределения частот генотипов равновесию Харди-Вайнберга. Анализ распределения частот встречаемости аллелей и генотипов полиморфных вариантов C282T, C481T, G590A, A803G и G857A гена NAT2 показал отсутствие статистически значимых различий между общей группой больных раком легкого и контрольной группой (табл. 6).

Таблица 6

Распределение генотипов полиморфных вариантов гена NAT2

у больных раком легкого и в контрольной группе

Генотипы

Рак легкого

Контроль

р

Абс.

Частота

Абс.

Частота

С282Т

СС

53

0.434

78

0.467

0.667

СТ

55

0.451

70

0.419

0.667

ТТ

14

0.115

19

0.114

0.872

С481Т

CC

39

0.320

59

0.353

0.638

CT

68

0.557

79

0.473

0.195

TT

15

0.123

29

0.174

0.308

G590A

GG

59

0.484

72

0.431

0.444

GA

51

0.418

80

0.479

0.363

AA

12

0.098

15

0.090

0.967

A803G

AA

53

0.434

55

0.329

0.089

AG

53

0.434

87

0.521

0.182

GG

16

0.131

25

0.150

0.783

G857A

GG

116

0.951

158

0.946

0.928

GA

6

0.049

9

0.054

0.928

Опыт молекулярно-эпидемиологических исследований показывает, что сила ассоциации признака с заболеванием в объединенных группах может быть слабой и не достигать уровня достоверности вследствие разнонаправленных эффектов многих неучтенных факторов (Garte, 2001). Поэтому был выполнен анализ распределения частот аллелей и генотипов гена NAT2 c учетом фактора курения и пола.

В результате проведенного анализа с учетом пола выявлены достоверные различия в частоте встречаемости аллеля 803G у мужчин больных раком легкого (30.8%) по сравнению с мужчинами контрольной группы (42.4%) (2 = 4.97, p = 0.026). Значение ОШ = 0.60 свидетельствует об ассоциации аллеля 803G с устойчивостью к возникновению рака легкого у мужчин. При анализе распределения генотипов по этому полиморфизму выявлено, что «дикий» генотип 803AA достоверно чаще встречался у больных раком легкого мужчин (47.4%) по сравнению с мужчинами контрольной группы (31.9) (2 = 4.17, р = 0.041). Значение ОШ = 1.92 свидетельствует об ассоциации данного генотипа с предрасположенностью к раку легкого у мужчин. По полиморфным вариантам C282T, C481T, G590A и G857A гена NAT2 статистически значимых различий между группой больных раком легкого и контрольной группой при учете фактора курения не обнаружено.

Рис. 8. Распределение частот генотипов полиморфного варианта A803G гена NAT2 и аллеля 803G у мужчин в группе больных раком легкого и в контрольной группе.

Далее был проведен анализ ассоциаций полиморфных вариантов гена NAT2 с учетом и пола, и фактора курения. В подгруппе больных раком легкого не оказалось курящих женщин, поэтому анализ выполнен для трех подгрупп (некурящих женщин, курящих мужчин и некурящих мужчин). Анализ распределения частот встречаемости аллелей и генотипов полиморфных вариантов C282T, C481T, G590A и G857A гена NAT2 показал отсутствие статистически значимых различий между группой больных раком легкого и контрольной группой при учете и пола, и фактора курения.

Pages:     | 1 | 2 || 4 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»