WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     || 2 | 3 |

Представлены сведения о предстоящей защите диссертации на соискание ученой степени кандидата медицинских наук

Тимковская Елизавета Ефимовна

«Анализ ряда генов как возможных генов-модификаторов клинической картины муковисцидоза у больных из России»

03.00.15 генетика; 14.00.09 педиатрия

медицинские науки

Д 001.016.01

ГУ Медико-генетический НЦ РАМН

115478, Москва, ул. Москворечье, 1, МГНЦ РАМН

Тел: 8 (499) 612-86-07

www. med-gen. ru

Предполагаемая дата защиты диссертации 05 ноября 2007 года

Представлена на сайте МГНЦ РАМН 25.07.2007

Работа принята к защите 09.07.2007

На правах рукописи

Тимковская Елизавета Ефимовна

АНАЛИЗ РЯДА ГЕНОВ КАК ВОЗМОЖНЫХ ГЕНОВ-МОДИФИКАТОРОВ КЛИНИЧЕСКОЙ КАРТИНЫ МУКОВИСЦИДОЗА У БОЛЬНЫХ ИЗ РОССИИ

03.00.15. – генетика

14.00.09. – педиатрия

АВТОРЕФЕРАТ

Диссертации на соискание ученой степени

кандидата медицинских наук

Москва, 2007

Работа выполнена в ГУ Медико-генетический научный центр РАМН

Научные руководители:

кандидат биологических наук, Н.В. Петрова

доктор медицинских наук, Н.Ю. Каширская

Официальные оппоненты:

доктор биологических наук, профессор А.В. Поляков

доктор медицинских наук, профессор И.К. Волков

Ведущая организация:

Государственное образовательное учреждение дополнительного профессионального образования Российская медицинская академия последипломного образования Министерства здравоохранения и социального развития РФ

Защита диссертации состоится « » 2007 г. в « » часов на заседании Диссертационного совета Д 001.016.01 в ГУ Медико-генетический научный центр РАМН по адресу: 115478, Москва, ул. Москворечье, д. 1.

С диссертацией можно ознакомиться в научной библиотеке ГУ Медико-генетический научный центр РАМН по адресу: 115478, Москва,

ул. Москворечье, д. 1.

Автореферат разослан « » 2007 г.

Ученый секретарь

Диссертационного совета,

доктор биологических наук, профессор Л. Ф. Курило

ВВЕДЕНИЕ

Актуальность темы. Муковисцидоз (МВ)- частое аутосомно-рецессивное заболевание, обусловленное мутацией гена CFTR, характеризующееся клиническим полиморфизмом.

Частота МВ в Европе, в среднем, составляет 1:3000 – 1:3500 новорожденных, в России, по разным оценкам, от 1:4900 до 1:12000. [Капранов Н.И. и др., 2004; Радионович А.М. и др., 2005].

Продолжительность жизни, спектр и тяжесть клинических проявлений значительно варьируют среди больных МВ.

Значительное количество симптомов МВ и осложнений могут отсутствовать у одних больных на протяжении всей жизни, тогда как у других имеется почти полный их спектр уже в раннем возрасте. К таким проявлениям, например, относятся: мекониальный илеус и синдром дистальной интестинальной обструкции, недостаточность поджелудочной железы, цирроз, сахарный диабет, остеопороз, а также колонизация Pseudomonas aeruginosa, существенно ухудшающая течение и прогноз заболевания.

Вариабельность клинического течения лишь отчасти обусловлена CFTR генотипом [CFG-PC, 1993; Ferrari M., Cremonesi L., 1996; Parad R.B. et al., 1999; McKone E.F. et al., 2006].

Различное течение МВ наблюдается у больных, проживающих в равных социальных условиях, наблюдаемых в одних медицинских центрах и имеющих одинаковые мутации в гене CFTR, в частности, у сибсов. Причем конкордантность по тяжести заболевания у монозиготных близнецов, достоверно выше, чем у дизготных [Mekus N. et al., 2000; Vanscoy L.L. et al., 2007]. Это позволяет предполагать влияние на клиническую картину МВ других генетических факторов, отличных от гена CFTR.

В связи с широкой вариабельностью клинической картины идентификация генов, вовлеченных в патогенез отдельных синдромов МВ, является важной медико-генетической задачей во всем мире. Изучается ряд генов, белковые продукты которых могут быть вовлечены в патогенетические механизмы МВ [Drumm M.L. et al., 2005; Salvatore F. et al., 2002; Witt H., 2003].

В нашей стране молекулярно-генетические работы, посвященные изучению генов, модифицирующих клинические проявления МВ, немногочисленны и проведены на выборках больных МВ небольшого размера без учета CFTR генотипа [Иващенко Т.Э., Баранов В.С., 2002; Корытина Г.Ф. и др., 2004; Келемберт Н.А. и др., 2005].

Возможность прогнозировать дальнейшее течение заболевания и возникновение определенных осложнений позволит оптимизировать проведение профилактических и лечебных мероприятий и может способствовать созданию новых этиопатогенетических подходов к терапии заболевания, что будет способствовать дальнейшему увеличению продолжительности и повышению качества жизни больных.

Цель исследования: изучение возможного модифицирующего влияния генов eNOS, TNFA, LTA, GSTM1, MBL2, HFE на клинические проявления МВ у российских больных.

Задачи исследования:

  1. Составить регистр обследованных больных муковисцидозом с указанием их генотипа и особенностей течения заболевания.
  2. Проанализировать частоты полиморфизмов в генах еNOS, TNFA, LTA, GSTM1, MBL2, HFE среди больных муковисцидозом и здоровых индивидов.
  3. Изучить ассоциации полиморфизмов в указанных генах с течением бронхолегочного процесса у больных муковисцидозом.
  4. Изучить взаимосвязь данных полиморфизмов с тяжестью проявлений кишечного синдрома у больных муковисцидозом.

Научная новизна и практическая значимость. Впервые получена оценка частот аллелей и генотипов полиморфных локусов генов еNOS, TNFA, LTA, GSTM1, MBL2, HFE в выборке больных МВ, гомозиготных по мутации F508del, проживающих на территории Российской Федерации.

Впервые определены частоты мутаций в первом экзоне, а также аллелей и генотипов промоторного полиморфизма в гене MBL2 у здоровых индивидов, проживающих на территории Европейской части России.

Проведен анализ связей данных полиморфных локусов с клиническими проявлениями муковисцидоза и выявлены ассоциации с тяжестью бронхолегочной патологии и рядом осложнений МВ. Впервые у больных МВ, носителей аллеля A VNTR eNOS4, установлено менее благоприятное развитие бронхолегочного процесса и особенности поражения печени. У пациентов, являющихся носителями мутации Н63D в гене HFE, выявлено более тяжелое поражение желудочно-кишечного тракта и более благоприятное течение бронхолегочного процесса. Впервые в России показана ассоциация тяжести бронхолегочного процесса и кишечного синдрома у больных МВ с мутантными аллелями гена MBL2.

Результаты работы вносят вклад в общее представление о генах-модификаторах клинической картины МВ. Полученные в работе данные имеют существенное значение для проведения ДНК-диагностики с целью выявления факторов риска развития ряда осложнений МВ.

Положения, выносимые на защиту:

  1. Определены особенности клинической картины МВ у больных, гомозиготных по мутации F508del, из России: для них в большей мере характерна смешанная форма заболевания, а также быстрое прогрессирование бронхолегочного процесса и поражения гепатобилиарной системы.
  2. Частоты изученных мутаций и полиморфизмов в генах TNFA, LTA, GSTM1, MBL2, HFE в выборках здоровых индивидов и больных МВ, гомозиготных по мутации F508del, не различаются. Выявлено достоверное различие частот аллелей полиморфизма VNTR eNOS4 между выборками больных МВ и здоровых индивидов.
  3. Установлена ассоциация тяжести бронхолегочного процесса при МВ с полиморфизмом VNTR 27 п.н. в 4 интроне гена eNOS, мутациями R52C, G54D, G57E и полиморфизмом -221 G-C гена MBL2, мутацией H63D гена HFE. У больных МВ, гомозиготных по мутации F508del, отмечены более тяжелые проявления со стороны легких среди пациентов, имеющих мутантные аллели MBL2 и eNOS, а также у индивидов, гомозиготных по аллелю Н63 гена HFE.
  4. Выявлена ассоциация проявлений со стороны желудочно-кишечного тракта у больных МВ, гомозиготных по мутации F508del, с мутациями и полиморфизмами генов eNOS, GSTM1, MBL2 и HFE. Обнаружено снижение частоты цирроза и увеличение частоты фиброза у больных МВ, имеющих аллель eNOS4*A. Выявлено увеличение частоты фиброза печени среди пациентов, гомозиготных по делеционному полиморфизму GSТM1. Отмечена более ранняя манифестация кишечного синдрома среди больных МВ, носителей мутации H63D гена HFE. Обнаружено увеличение частоты мекониального илеуса и синдрома дистальной интестинальной обструкции среди пациентов с мутантными аллелями генов HFE и MBL.
  5. Отмечена ассоциация более позднего возраста постановки диагноза среди больных, гомозиготных по мутации F508del, с наличием аллеля А полиморфизма -308 G-A гена TNFA.

Апробация работы. Материалы работы были представлены на VII Национальном Конгрессе по муковисцидозу, 5-6 апреля 2005 года, г.Воронеж; V съезде Российского общества медицинских генетиков, май 2005 года, г.Уфа; VIII Национальном конгрессе по муковисцидозу, июнь 2007 года, г.Ярославль; лабораторных и межлабораторном семинарах ГУ МГНЦ РАМН.

Публикации. По теме диссертации опубликовано 14 печатных работ.

Объем и структура работы. Работа изложена на 163 страницах; состоит из введения, обзора литературы, глав «материалы и методы», «результаты и обсуждение», заключения, выводов, практических рекомендаций, приложений и списка литературы (186 источника, из них 149 зарубежных). Работа проиллюстрирована 20 таблицами и 25 рисунками.

МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ.

Нами было проанализировано 148 историй болезни детей, больных муковисцидозом, гомозиготных по мутации F508del, проживающих в РФ, находившихся на постоянном амбулаторном учете и обследованных в научно-клиническом отделе муковисцидоза (Российский центр муковисидоза) (руководитель - д.м.н. проф. Н.И. Капранов) с 1991 по 2006 год. Анализируемые параметры включали: пол, возраст, место проживания, проводимую терапию, время манифестации кишечного и респираторного синдрома, возраст постановки диагноза, форму заболевания, тяжесть течения, показатели ФВД (ФЖЕЛ и ОФВ1), результаты посева мокроты (наличие высева, его периодичность, существование мукоидной или гладкой формы P.aeruginosa, наличие высева St.aureus, MRSA, Al.xylosoxidans, B.сepacia, St.maltophilia), массо-ростовой индекс (МРИ), поражение гепатобилиарной системы и наличие в анамнезе мекониального илеуса.

Анализ полиморфизмов генов-модификаторов проводили в выборке больных МВ, гомозиготных по мутации F508del, и контрольной выборке здоровых индивидов. Выборка здоровых индивидов (289 человек) по полу, возрасту, этнической принадлежности и месту проживания соответствовала выборке анализируемых больных. Выделение геномной ДНК проводили из лейкоцитов венозной крови набором реактивов «Wizard Genomic DNA Purification Kit» фирмы «Promega» (USA) в соответствии с рекомендациями производителя.

Амплификацию всех исследуемых фрагментов ДНК проводили методом полимеразной цепной реакции на программируемом термоциклере МС2 производства фирмы “ДНК-технология” (Россия) с использованием ДНК-полимеразы Biotaq (“БиоМастер”) и олигонуклеотидных праймеров, которые синтезировались в НПО «Литех» (Россия).

Исследование полиморфизмов изучаемых генов проводили методом ПДРФ-анализа [Monti L.D. et al.,2003; Zhang D.L., 2003; Пай Г.В. и др., 2003; Madsen et al., 1998; Beutler E. et al., 1996]. Результаты оценивали с помощью электрофореза в полиакриламидном геле с последующим окрашиванием раствором бромистого этидия и регистрацией с помощью документирующей системы Vilber Lourmat (Франция) в УФ-свете. В работе использовались эндонуклеазы производства Fermentas (Литва), «Сибэнзим» (Россия).

Статистическую обработку полученных данных проводили с использованием параметрической и непараметрической статистики в зависимости от шкал и характера распределения переменных. Для анализа ассоциаций между полиморфными вариантами изучаемых генов и количественными характеристиками течения заболевания использовали непараметрический критерий Манна-Уитни. Расчет данного критерия осуществляли с использованием пакета «Statistica 6.0». Анализ качественных признаков проводили на основе сравнения частот их проявления в исследуемых группах, с последующей попарной проверкой статистической достоверности различий значений частот с использованием критериев согласия 2, двустороннего теста Фишера, модифицированного 2 [Животовский, 1991]. Расчет осуществляли с использованием пакета программ, имеющегося в лаборатории, составленного сотрудниками д.б.н. Ельчиновой Г.И., д.б.н. Нурбаевым С.Д..

РЕЗУЛЬТАТЫ И ОБСУЖДЕНИЕ

Активный поиск кандидатных генов, оказывающих влияние на характер течения МВ, ведется в настоящее время многими группами исследователей. Особое внимание уделяется генам, вовлеченным в процессы иммунной защиты и воспаления [Drumm M.L. et al., 2005; Salvatore F. et al., 2002; Witt H., 2003].

Изучение модулирующего влияния кандидатных генов-модификаторов следует проводить в группе больных с одинаковым CFTR генотипом для исключения возможного специфического влияния разных мутаций гена CFTR на фенотип [CFGPC, 1993; Каширская Н.Ю., 2001; de Gracia J., et al., 2005; Loubieres M.D., et al., 2002; McKone E.F., et al., 2003; Salvatore F., 2002].

Pages:     || 2 | 3 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»