WWW.DISSERS.RU

БЕСПЛАТНАЯ ЭЛЕКТРОННАЯ БИБЛИОТЕКА

загрузка...
   Добро пожаловать!

Pages:     | 1 || 3 | 4 |   ...   | 5 |

Наибольшее число мутаций в исследованной нами выборке было выявлено в гене BRCA1 - 15 мутаций (14,8%), в то время как в гене BRCA2 – 2 мутации (2%). Соотношение частоты мутаций в гене BRCA1 к случаям мутаций в гене BRCA2 составило приблизительно 8 к 1. Этот результат хорошо соотносятся с данными многочисленных исследований, согласно которым частота мутаций в гене BRCA1 превышает таковую в гене BRCA2 независимо от этнической принадлежности индивидуумов в исследуемой выборке.

В гене BRCA2 нами были обнаружены две известные миссенс-мутации – K1690N и K1888R (2%). Первая приводит к замене кодируемой аминокислоты лизин на аспарагин, вторая – лизин на аргинин. Значительная доля миссенс-мутаций в спектре гена BRCA2 характерна для не отобранных по семейной истории выборок РЯ и из других популяций. В подобной выборке, изученной в США, миссенс-варианты в гене BRCA2 составили более половины [Pal T., 2005]. В Польше - почти все найденные среди больных изменения структуры в гене BRCA2 являлись миссенс-вариантами [Majdak E.J. et al., 2005]. Хотя точное значение таких вариантов, как правило, неизвестно, имеются основания рассматривать их в качестве аллелей риска [Malander S. et al., 2004].

Спектр мутаций в гене BRCA1

Среди мутаций в гене BRCA1 преобладала мутация 5382insC с долей, составившей 60% (9/15). Остальную часть спектра составили 4 мутации – C61G, 185delAG, 4154delA, 2080delA (рис. 2). Таким образом, мутации преимущественно связаны с геном BRCA1 и характеризуются узким спектром (до 60% составляет одна мутация 5382insC). Полученные данные указывают на возможность определения нескольких мутаций в гене BRCA1 при формировании групп повышенного риска развития РЯ, что существенно упрощает исследование без уменьшения эффективности и предопределяет осуществимость скрининга.

Рис.2. Спектр мутаций в гене BRCA1 при раке яичников.

С другой стороны, близкие характеристики спектра мутаций и высокую частоту мутации 5382insC в российской выборке наблюдали ранее при изучении семейного рака молочной железы [Карпухин А.В. с соавт., 2006]. Следовательно, один и тот же набор мутаций формирует предрасположенность и к РЯ, и к РМЖ, указывая на то, что иные, нежели положение мутации в гене, генотипические особенности влияют на локализацию BRCA-ассоциированного рака.

Анализ семейной истории больных раком яичников с мутациями в генах BRCA1/2

Среди больных РЯ с мутацией в гене BRCA1 или BRCA2 выяснили наличие родственников, имевших диагноз РЯ и/или РМЖ. Семейный анамнез одного больного был не доступен. Было установлено, что 14 из 16 (88%) изученных больных BRCA-ассоциированным РЯ имели родственников с РЯ и/или РМЖ

Рассмотренные в ходе настоящей работы семьи пробандов отличались по соотношению случаев РЯ и РМЖ у родственников, что позволило распределить семьи на две группы. Первую группу составили семьи, в которых среди родственников встречается только РЯ или РЯ является более частым, чем РМЖ, заболеванием (РЯ–семьи). Вторую группу составили семьи, в которых РМЖ является преобладающим над РЯ заболеванием (РМЖ - семьи). Мы наблюдали примерно одинаковое распределение семей между двумя группами: 8 РЯ-семей и 6 РМЖ-семей. Для каждой группы семей мы суммировали обнаруженные мутации. Оказалось, что преобладающей мутацией среди двух групп семей была 5382insC: среди РЯ-семей доля 5382insC составила 63%, а среди РМЖ-семей - 50%. Таким образом, как в РЯ-, так и в РМЖ-семьях преобладает мутация 5382insC, что является дополнительным свидетельством о наличии иных, нежели положение мутации в гене, генотипических особенностях, влияющих на локализацию BRCA-ассоциированного рака.

Следовательно, характеристики спектра мутаций не позволяют связать локализацию рака с положением мутаций в гене. Другим генетическим фактором, потенциально способным влиять на риск рака той или иной локализации, являются однонуклеотидные полиморфизмы в генах BRCA1/2.

Исследование однонуклеотидных полиморфизмов

В данном разделе работы исследовали четыре выборки больных, отличающихся по локализации рака и наличию/отсутствию наследуемых мутаций в генах BRCA1/2 (табл.1). Во всех указанных выборках определяли частоты генотипов по трем полиморфным вариантам в генах BRCA1/2, которые сравнивали с частотами в контрольной выборке.

Таблица 1

Характеристика исследованных выборок.

Номер выборки

Характеристика выборки

Размер выборки, человек

Условное обозначение выборки

1

пациенты с диагнозом РЯ без обнаруженных мутаций в генах BRCA1/2, спорадический РЯ

84

СРЯ

2

пациенты с диагнозом РЯ с обнаруженной мутацией в гене BRCA1

33

МРЯ

3

пациенты с диагнозом РМЖ с обнаруженной мутацией в гене BRCA1

41

МРМЖ

4

пациенты с диагнозом РМЖ без обнаруженных мутаций в гене BRCA1/2, спорадический РМЖ

94

СРМЖ

5

контрольная группа, сформированная из женщин, семьи которых и они сами не были отягощены ни РЯ, ни РМЖ.

109

К

Всего

353

На рис.3 представлен пример электрофоретического генотипирования методом CSGE некоторых пробандов по ОНП N372H в гене BRCA2.

Рис.3. Генотипирование по полиморфизму N372H в гене BRCA2 с помощью метода конформационно-чувствительного электрофореза. Под каждой дорожкой указан соответствующий генотип: N/N – N372N; N/H – N372H; H/H – H372H.

Изучение ОНП в выборке спорадического рака яичников

В выборке СРЯ нами было обнаружено отличие в распределении частот генотипов по полиморфизму 203G>A от частот, наблюдаемых в контрольной выборке (табл.2). Генотип 203A/A достоверно чаще встречался в выборке СРЯ по сравнению с контрольной выборкой, а генотип 203G/A, напротив – реже. Присутствие генотипа 203A/A по полиморфизму 203G>A было связано с увеличенным риском развития СРЯ (OR = 5,9; р = 0,01), а генотипа 203G/A – напротив – с его уменьшением (OR = 0,5; р = 0,03).

Таблица 2.

Результаты генотипирования по исследованным ОНП в выборке больных спорадическим РЯ и в контрольной выборке.

ген

полиморфизм

Генотип по полиморфизму

Количество

генотипов в контрольной выборке

Количество

генотипов в выборке СРЯ

OR

p

BRCA1

E1038G

E1038E

49

44

1,3

0,30

E1038G

42

28

0,8

0,45

G1038G

18

12

0,8

0,69

BRCA2

203G>A

203G/G

58

48

1,2

0,66

203G/A

48

24

0,5

0,03

203A/A

3

12

5,9

0,01

N372H

N372N

67

45

0,7

0,30

N372H

37

34

1,3

0,37

H372H

5

5

1,3

0,75

Примечания: жирным шрифтом отмечены достоверно значимые значения OR.

Изучение ОНП в выборке BRCA-ассоциированного рака яичников

В выборке МРЯ нами было обнаружено аналогичное наблюдавшемуся в выборке СРЯ отличие частот генотипов по полиморфизму 203G>A от контрольной выборки: генотип 203A/A чаще встречался в выборке МРЯ (OR=4,9; р=0,05), а генотип 203G/A, напротив – реже (OR=0,4; р=0,04). Единый характер отличий частот генотипов от контроля, наблюдаемый в выборках спорадического и BRCA1-ассоциированного РЯ, свидетельствует о наличии общих механизмов модификации риска, свойственных данным формам РЯ. Сравнение частот всех генотипов в выборках СРЯ и МРЯ не выявило достоверно значимых отличий (диапазон значений р от 0,14 до 0,83), что позволило объединить две данные выборки больных РЯ. Характеристики распределения генотипов по ОНП в генах BRCA1/2 были изучены в объединенной выборке РЯ. Мы получили результаты, аналогичные таковым для отдельных выборок РЯ, при этом уровень значимости различий частот увеличился на порядок: при генотипе 203A/A OR=5,8 (р=0,003), при генотипе 203G/A OR=0,5 (р=0,008). Таким образом, выявлены генотипы, модифицирующие риск развития РЯ, при этом их эффект проявляется независимо от присутствия или отсутствия мутации в гене BRCA1. Чтобы определить, связан ли модифицирующий эффект полиморфизма 203G>A на развитие рака именно данной локализации, были проанализированы выборки спорадического и BRCA-ассоциированного РМЖ.

Изучение ОНП в выборке BRCA-ассоциированного рака молочной железы

В выборке BRCA1-ассоциированного РМЖ мы не обнаружили достоверно значимых отличий в частотах генотипов по исследованным ОНП от частот в контрольной выборке. Следовательно, в отличие от модификации риска РЯ, изученные варианты в генах BRCA1/2 не влияют на риск рака молочной железы при мутациях в гене BRCA1.

Изучение ОНП в выборке спорадического рака молочной железы

В выборке CРМЖ установили уменьшенную по сравнению с контрольной выборкой частоту генотипа 203G/A (OR=0,5; p=0,02) и увеличенную частоту генотипа E1038G (OR=2,1; p=0,01). Следовательно, в выборке СРМЖ наблюдаются как сходные с полученными при исследовании выборки РЯ характеристики (уменьшение риска при генотипе 203G/A), так и отличающиеся (увеличение риска при генотипе E1038G).

Суммарные данные по исследованным выборкам представлены в табл.3. Из приведенных результатов следует совпадение генотипов, модифицирующих риск развития двух форм РЯ, как при мутациях, так и без мутаций в генах BRCA1/2, и отличия в профиле ассоциированных с риском ОНП между РЯ и РМЖ: для выборок рака различной локализации характерны специфические генотипы риска по ОНП.

Отдельные исследования показывают, что увеличенный риск развития РМЖ и РЯ может быть связан с различными генотипами, указывая на особенности генотип-фенотипического проявления ОНП [Hughes D.J. et al, 2005]. Одно из направлений настоящего исследования заключалось в установлении суммарной картины влияния ОНП генов BRCA1/2 на риск развития РМЖ и РЯ как при мутациях, так и без мутаций в указанных генах.

генотип

Pages:     | 1 || 3 | 4 |   ...   | 5 |






© 2011 www.dissers.ru - «Бесплатная электронная библиотека»